恭喜宁波海尔施基因科技股份有限公司李宝连获国家专利权
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龙图腾网恭喜宁波海尔施基因科技股份有限公司申请的专利一种定量聚合酶链反应的肘点CT值自动计算方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119049550B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-05-27发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411515007.7,技术领域涉及:G16B25/20;该发明授权一种定量聚合酶链反应的肘点CT值自动计算方法是由李宝连;郭学全;梁育设计研发完成,并于2024-10-29向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种定量聚合酶链反应的肘点CT值自动计算方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种定量聚合酶链反应的肘点CT值自动计算方法,涉及生物信息技术领域,主要包括步骤:根据原始荧光值进行线性判定下的扩增曲线分型,并基于扩增曲线指数扩增期的曲线变化特点进行肘点近似点位的筛选,基于扩增曲线饱和平台期的曲线变化特点进行膝点近似点位的筛选;根据肘点近似点和膝点近似点之间的原始荧光值扩增曲线进行拟合,基于最优拟合后的方程为线性区方程;根据肘点近似点之前的原始荧光值扩增曲线进行拟合,基于最优拟合后的方程为基线区方程;基于线性区方程与基线区方程进行交点求解,并将该交点作为目标肘点CT值。本发明所获得的结果完全反应了原始扩增曲线的特征,所获得的定量结果更加稳定。
本发明授权一种定量聚合酶链反应的肘点CT值自动计算方法在权利要求书中公布了:1.一种定量聚合酶链反应的肘点CT值自动计算方法,其特征在于,包括步骤:S1:获取定量聚合酶链反应过程中预设循环次数下的原始荧光值扩增曲线;S2:根据前预设个循环的荧光值进行扩增曲线初步判断,并在判断存在有效扩增曲线后进入下一步骤,否则结束;S3:根据原始荧光值进行线性判定下的扩增曲线分型,并基于扩增曲线指数扩增期的曲线变化特点进行肘点近似点位的筛选,基于扩增曲线饱和平台期的曲线变化特点进行膝点近似点位的筛选;S4:根据肘点近似点和膝点近似点之间的原始荧光值扩增曲线进行拟合,基于最优拟合后的方程为线性区方程;S5:根据肘点近似点之前的原始荧光值扩增曲线进行拟合,基于最优拟合后的方程为基线区方程;S6:基于线性区方程与基线区方程进行交点求解,并将该交点作为目标肘点CT值;所述S3步骤中,扩增曲线分型包括基线区、指数扩增区、线性增长区、对数增长区和饱和平台区;通过搜索循环点位间荧光值变化趋势稳定的起止端点进行扩增曲线的分型,其中,循环点位间荧光值变化趋势通过如下公式判定: 式中,为循环点位间荧光值变化趋势,c为大于等于1的梯格常数,为第n次循环时的荧光值,通过搜索对应的循环点位进行起止端点的获取;扩增曲线指数扩增期的曲线变化特点为由基线区的低荧光值状态进入荧光值指数增长的指数增长区,其中,肘点的荧光值增长速度趋势通过如下公式判定: 式中,为肘点的荧光值增长速度趋势,通过搜索原始荧光值扩增曲线中起始低荧光值并接着指数增长范围内对应的循环点位进行肘点近似点位的筛选;扩增曲线饱和平台期的曲线变化特点为由线性区的荧光值线性增长转入对数增长区后最终进入停滞增长的饱和平台区,其中,膝点的荧光值增长速度趋势通过如下公式判定: 式中,M为最大荧光值,N为系统噪声基线,为修正后第n次循环时的荧光值,为膝点的荧光值增长速度趋势,通过搜索原始荧光值扩增曲线中荧光值对数增长并最终进入停滞增长范围内对应的循环点位进行膝点近似点位的筛选。
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