恭喜安徽大学;中国电子科技集团公司第三十八研究所刘玉获国家专利权
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龙图腾网恭喜安徽大学;中国电子科技集团公司第三十八研究所申请的专利物种特异性蛋白质翻译后修饰位点预测方法及系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN114724629B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-06-20发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202210405901.3,技术领域涉及:G16B20/30;该发明授权物种特异性蛋白质翻译后修饰位点预测方法及系统是由刘玉;王强;王安设计研发完成,并于2022-04-18向国家知识产权局提交的专利申请。
本物种特异性蛋白质翻译后修饰位点预测方法及系统在说明书摘要公布了:本发明提供物种特异性蛋白质翻译后修饰位点预测方法及系统包括:通过数据预处理获取翻译后修饰位点及差异物种训练样本;构建出序列特征提取网络并设置分类器及领域类别判别器;语义对抗策略处理所述差异物种训练样样本,以得到样本配对组;使用所述人类翻译后修饰样本训练所述序列特征提取网络及分类器,根据所述样本配对组训练领域类别判别器,以区分输入样本对的组别信息,交替训练序列特征提取网络和领域类别判别器,以使所述序列特征提取网络、所述分类器及所述领域类别判别器学习到领域不变性判别特征空间;评估深度神经网络的性能。解决了预测方式低效、昂贵、耗时、拟合以及预测精度低的技术问题。
本发明授权物种特异性蛋白质翻译后修饰位点预测方法及系统在权利要求书中公布了:1.物种特异性蛋白质翻译后修饰位点预测方法,其特征在于,所述方法包括: S1、从预置数据库中收集整理差异物种的泛素化、乙酰化翻译后修饰位点,并利用滑动窗口技术提取所述翻译后修饰位点的局部序列,以构建数据集,独热编码所述数据集中的蛋白质局部序列,以获取翻译后修饰位点及差异物种训练样本; S2、在卷积神经网络的基础上增加密集连接,以使每个卷积层都接收前面所有的所述卷积层的特征图,据以构建出序列特征提取网络并设置分类器及领域类别判别器;其中,步骤S2包括: S21、为卷积神经网络的卷积模块设置密集连接,以下述逻辑使每个卷积层都接收前面所有的卷积层的特征图: , 式中,表示对特征图进行拼接操作,Wi为卷积核权重; S22、以下述逻辑在每个卷积模块后增加一瓶颈层,以降低特征的通道数: hB=αBWBhM+bB, 式中,hM为所述卷积模块的输出,WB,bB和αB分别表示所述瓶颈层中卷积核的权重、偏置项和激活函数; S23、设置分类器及所述领域类别判别器; S3、利用语义对抗策略配对处理所述差异物种训练样样本,以得到人类翻译后修饰样本及其他物种翻译后修饰样本的样本配对组; S4、使用所述人类翻译后修饰样本训练所述序列特征提取网络及分类器,根据所述样本配对组训练领域类别判别器,以区分输入样本对的组别信息,利用交替的方式分别训练序列特征提取网络和领域类别判别器,直至损失函数收敛,以使所述序列特征提取网络、所述分类器及所述领域类别判别器学习到领域不变性判别特征空间; S5、从所述翻译后修饰位点中划分得到独立测试集,据以评估所述序列特征提取网络、所述分类器及所述领域类别判别器的性能。
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