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申请/专利权人：上海市农业科学院

申请日：2020-12-21

公开（公告）日：2023-04-07

公开（公告）号：CN112575108B

专利技术分类：....· · · 用于植物、真菌或藻类[2018.01]

专利摘要：本发明提供了紫菜薹SSR分子标记，SSR指纹图谱及其建立方法和应用，涉及分子生物学和植物品种鉴别技术领域。本发明通过分析紫菜薹基因组序列获得了基因组SSR分子标记，并根据序列合成了30对SSR引物，构建了紫菜薹鉴定的SSR指纹图谱，利用PCR扩增技术和电泳检测技术对紫菜薹品种进行检测，可在短时间内完成紫菜薹品种鉴定与遗传多样性评价工作，可高效、准确、低成本对紫菜薹品系或其野生近缘种进行鉴定。本发明的鉴定方法可对紫菜薹真伪进行有效监控，从DNA水平揭示品种的遗传变异与遗传关系，保护了农作物品种，防止假冒伪劣产品进入市场。

专利权项：1.一种紫菜薹品种的鉴定方法，其特征在于，包括以下步骤：（1）提取待检紫菜薹样品的基因组DNA，采用SSR分子标记的引物分别对待检样品的基因组DNA进行PCR扩增；（2）PCR扩增产物进行电泳检测和测序；（3）根据电泳检测中扩增产物的相对位置，记录扩增产物的有无，和或共显性标记中无效、纯合位点、杂合位点等位变异大小；所述纯合位点的等位变异大小记录为XX，所述杂合位点的等位变异大小记录为XY，其中X、Y为所述位点上两个不同的等位变异；其中，紫菜薹SSR指纹图谱中“”前为小片段，“”后为大片段；（4）将步骤（3）的结果对照紫菜薹SSR指纹图谱，根据样品间差异位点数，判断紫菜薹品种；所述SSR分子标记为下述30个基因组SSR分子标记的组合：SA000189-cnu_m139a、SA000190-nia_m086a、SA000191-nia_m098a、SA000192-nia_m138a、SA000193-cnu_m046a、SA000194-nia_m121a、SA000195-cnu_m073a、SA000196-cnu_m288a、SA000197-cnu_m316a、SA000198-cnu_m327a、SA000199-nia_m101a、SA000200-cnu_m252a、SA000201-Na10-D09、SA000202-cnu_m289a、SA000203-cnu_m442a、SA000204-cnu_m050a、SA000205-cnu_m149a、SA000206-nia_m037a、SA000207-nia_m049a、SA000208-cnu_m182a、SA000209-cnu_m295a、SA000210-cnu_m090a、SA000211-cnu_m537a、SA000212-cnu_m016a、SA000213-cnu_m530a、SA000214-cnu_m534a、SA000215-nia_m022a、SA000216-nia_m038a、SA000217-ENA2、SA000218-nia_m035a的组合；扩增所述SSR分子标记的引物对的核苷酸序列依次为：SEQIDNO.1-2、SEQIDNO.3-4、SEQIDNO.5-6、SEQIDNO.7-8、SEQIDNO.9-10、SEQIDNO.11-12、SEQIDNO.13-14、SEQIDNO.15-16、SEQIDNO.17-18、SEQIDNO.19-20、SEQIDNO.21-22、SEQIDNO.23-24、SEQIDNO.25-26、SEQIDNO.27-28、SEQIDNO.29-30、SEQIDNO.31-32、SEQIDNO.33-34、SEQIDNO.35-36、SEQIDNO.37-38、SEQIDNO.39-40、SEQIDNO.41-42、SEQNO.43-44、SEQIDNO.45-46、SEQIDNO.47-48、SEQIDNO.49-50、SEQIDNO.51-52、SEQIDNO.53-54、SEQIDNO.55-56、SEQIDNO.57-58、SEQIDNO.59-60；所述紫菜薹样品为普通绿叶紫菜薹CK；所述紫菜薹SSR指纹图谱如下所示： 。

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