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面向FRET应用的辅助圈选ROI系统 

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申请/专利权人:师大瑞利光电科技(珠海)有限公司

摘要:本发明涉及一种面向FRET应用的辅助圈选ROI系统,其通过模板匹配算法自动预选用户感兴趣区域,再通过算法筛选并保留最优区域,可排除死细胞、图片边缘不完整细胞、有丝分裂细胞对自动圈点结果的不良影响,可兼顾FRET实验的效率和准确性。

主权项:1.一种面向FRET应用的辅助圈选ROI系统,其特征在于,其包括如下软件模块:图像预处理模块:对图片进行预处理以提高图像质量和细胞的可视性;用户模板ROI采集模块:采集用于自动圈选的模板;自动圈选和校准模块,其包括死细胞干扰排除模块、模板匹配和自动圈选模块,以及自动校准模块;所述死细胞干扰排除模块:遍历每组图片,判断细胞轮廓是否为类圆形,是则判定其为死细胞区域,并将该区域从图像中抠除;所述模板匹配和自动圈选模块:在每张排除了死细胞干扰的图片上与采集的所述模板进行相似度匹配,通过归一化互相关算法找到与所述模板相关系数较大的区域,并判断是否满足荧光强度条件,满足则进行圈选;所述自动校准模块:将靠近图片边缘处的圈选区域排除,确保只在视野中完整的细胞内进行圈选,当一个细胞轮廓内有多个圈选区域时,选择相关系数最大的区域进行保留,每张图片选择相关系数最大的n个区域进行保留,且两个区域之间的距离要求大于两个细胞的宽度。

全文数据:

权利要求:

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