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申请/专利权人：湖北省农业科学院畜牧兽医研究所

摘要：本发明公开了一种鉴定硒都黑猪品种的SNP位点集合及其应用，涉及猪品种鉴定领域。所述SNP位点位于猪参考基因组Sscrofa11.1版本，SNP位点集合包括182个SNP分子标记，如说明书表1所示。本申请中利用分子生物学技术在基因组水平筛选的品种特异性分子标记，可用于硒都黑猪品种的真伪鉴定和亲缘关系分析，为硒都黑猪品种的知识产权保护提供了有效的科学依据。在对硒都黑猪品种鉴定评价时，只需将硒都黑猪品种与已有特异性分子标记比较分析，即可确定其是否为硒都黑猪品种。这大大减少了硒都黑猪种质资源鉴定评价的时间和成本，提高了硒都黑猪品种鉴定和评价的效率。

主权项：1.一种鉴定硒都黑猪品种的SNP位点集合，其特征在于，所述SNP位点位于猪参考基因组Sscrofa11.1版本，SNP位点集合包括如下182个SNP分子标记：SNP1：1号染色体，物理位置：21063486，突变碱基T，参考碱基C；SNP2：1号染色体，物理位置：118698308，突变碱基G，参考碱基A；SNP3：1号染色体，物理位置：146303400，突变碱基C，参考碱基G；SNP4：1号染色体，物理位置：251767561，突变碱基A，参考碱基G；SNP5：1号染色体，物理位置：258413565，突变碱基A，参考碱基G；SNP6：1号染色体，物理位置：259260470，突变碱基T，参考碱基C；SNP7：1号染色体，物理位置：262018109，突变碱基T，参考碱基C；SNP8：1号染色体，物理位置：264913488，突变碱基A，参考碱基G；SNP9：1号染色体，物理位置：272711295，突变碱基G，参考碱基A；SNP10：1号染色体，物理位置：273415002，突变碱基C，参考碱基T；SNP11：2号染色体，物理位置：3638899，突变碱基G，参考碱基C；SNP12：2号染色体，物理位置：4556344，突变碱基A，参考碱基G；SNP13：2号染色体，物理位置：17998398，突变碱基T，参考碱基C；SNP14：2号染色体，物理位置：18883199，突变碱基T，参考碱基C；SNP15：2号染色体，物理位置：21593898，突变碱基C，参考碱基T；SNP16：2号染色体，物理位置：27834339，突变碱基A，参考碱基C；SNP17：2号染色体，物理位置：28408062，突变碱基C，参考碱基G；SNP18：2号染色体，物理位置：28884058，突变碱基G，参考碱基A；SNP19：2号染色体，物理位置：30098505，突变碱基A，参考碱基G；SNP20：2号染色体，物理位置：34536302，突变碱基C，参考碱基T；SNP21：2号染色体，物理位置：37945462，突变碱基T，参考碱基C；SNP22：2号染色体，物理位置：53954419，突变碱基A，参考碱基T；SNP23：2号染色体，物理位置：57934569，突变碱基A，参考碱基G；SNP24：2号染色体，物理位置：80948868，突变碱基A，参考碱基G；SNP25：2号染色体，物理位置：80974448，突变碱基T，参考碱基C；SNP26：2号染色体，物理位置：83204384，突变碱基A，参考碱基C；SNP27：2号染色体，物理位置：84392897，突变碱基T，参考碱基C；SNP28：2号染色体，物理位置：93330354，突变碱基C，参考碱基T；SNP29：2号染色体，物理位置：99758980，突变碱基A，参考碱基G；SNP30：2号染色体，物理位置：99783630，突变碱基C，参考碱基T；SNP31：2号染色体，物理位置：124476168，突变碱基G，参考碱基A；SNP32：2号染色体，物理位置：145281975，突变碱基C，参考碱基A；SNP33：2号染色体，物理位置：145943946，突变碱基A，参考碱基T；SNP34：2号染色体，物理位置：146424891，突变碱基C，参考碱基T；SNP35：2号染色体，物理位置：147415414，突变碱基T，参考碱基C；SNP36：3号染色体，物理位置：480041，突变碱基C，参考碱基T；SNP37：3号染色体，物理位置：11834474，突变碱基A，参考碱基G；SNP38：3号染色体，物理位置：11974039，突变碱基A，参考碱基G；SNP39：3号染色体，物理位置：17553941，突变碱基T，参考碱基C；SNP40：3号染色体，物理位置：25792863，突变碱基G，参考碱基A；SNP41：3号染色体，物理位置：42237739，突变碱基G，参考碱基A；SNP42：3号染色体，物理位置：42549875，突变碱基T，参考碱基C；SNP43：3号染色体，物理位置：42677552，突变碱基T，参考碱基C；SNP44：3号染色体，物理位置：42694540，突变碱基C，参考碱基T；SNP45：3号染色体，物理位置：43287541，突变碱基A，参考碱基G；SNP46：3号染色体，物理位置：44391904，突变碱基C，参考碱基T；SNP47：3号染色体，物理位置：44403226，突变碱基C，参考碱基T；SNP48：3号染色体，物理位置：44595665，突变碱基T，参考碱基G；SNP49：3号染色体，物理位置：47758344，突变碱基G，参考碱基A；SNP50：3号染色体，物理位置：47885141，突变碱基T，参考碱基C；SNP51：3号染色体，物理位置：56043389，突变碱基A，参考碱基G；SNP52：3号染色体，物理位置：72278718，突变碱基C，参考碱基T；SNP53：3号染色体，物理位置：84948563，突变碱基T，参考碱基C；SNP54：3号染色体，物理位置：131448397，突变碱基A，参考碱基G；SNP55：4号染色体，物理位置：22265753，突变碱基T，参考碱基C；SNP56：4号染色体，物理位置：22425318，突变碱基T，参考碱基C；SNP57：4号染色体，物理位置：23413642，突变碱基G，参考碱基T；SNP58：4号染色体，物理位置：25593843，突变碱基G，参考碱基T；SNP59：4号染色体，物理位置：43296752，突变碱基G，参考碱基T；SNP60：4号染色体，物理位置：45065765，突变碱基G，参考碱基C；SNP61：4号染色体，物理位置：46244989，突变碱基C，参考碱基T；SNP62：4号染色体，物理位置：49290310，突变碱基T，参考碱基C；SNP63：4号染色体，物理位置：50495485，突变碱基A，参考碱基C；SNP64：4号染色体，物理位置：65134330，突变碱基G，参考碱基T；SNP65：4号染色体，物理位置：73702659，突变碱基A，参考碱基G；SNP66：4号染色体，物理位置：95202863，突变碱基C，参考碱基G；SNP67：4号染色体，物理位置：118194800，突变碱基A，参考碱基G；SNP68：5号染色体，物理位置：454387，突变碱基A，参考碱基C；SNP69：5号染色体，物理位置：580504，突变碱基T，参考碱基G；SNP70：5号染色体，物理位置：2276937，突变碱基G，参考碱基A；SNP71：5号染色体，物理位置：38467395，突变碱基A，参考碱基G；SNP72：5号染色体，物理位置：92426667，突变碱基G，参考碱基A；SNP73：5号染色体，物理位置：96689978，突变碱基G，参考碱基A；SNP74：5号染色体，物理位置：97118299，突变碱基G，参考碱基T；SNP75：6号染色体，物理位置：4350912，突变碱基G，参考碱基T；SNP76：6号染色体，物理位置：48650419，突变碱基A，参考碱基T；SNP77：6号染色体，物理位置：88686959，突变碱基A，参考碱基G；SNP78：6号染色体，物理位置：92282029，突变碱基G，参考碱基A；SNP79：6号染色体，物理位置：101270297，突变碱基G，参考碱基A；SNP80：6号染色体，物理位置：104259494，突变碱基T，参考碱基C；SNP81：6号染色体，物理位置：114104020，突变碱基T，参考碱基C；SNP82：6号染色体，物理位置：160087366，突变碱基T，参考碱基C；SNP83：6号染色体，物理位置：168232971，突变碱基T，参考碱基G；SNP84：7号染色体，物理位置：42983003，突变碱基C，参考碱基T；SNP85：7号染色体，物理位置：95196583，突变碱基A，参考碱基C；SNP86：7号染色体，物理位置：101398669，突变碱基G，参考碱基A；SNP87：7号染色体，物理位置：116356525，突变碱基A，参考碱基G；SNP88：8号染色体，物理位置：31995489，突变碱基T，参考碱基A；SNP89：8号染色体，物理位置：50218821，突变碱基G，参考碱基C；SNP90：8号染色体，物理位置：65840837，突变碱基G，参考碱基A；SNP91：8号染色体，物理位置：68090480，突变碱基C，参考碱基T；SNP92：9号染色体，物理位置：10022588，突变碱基C，参考碱基A；SNP93：9号染色体，物理位置：10131618，突变碱基A，参考碱基G；SNP94：9号染色体，物理位置：11222816，突变碱基A，参考碱基G；SNP95：9号染色体，物理位置：32070845，突变碱基A，参考碱基G；SNP96：9号染色体，物理位置：32698764，突变碱基T，参考碱基C；SNP97：9号染色体，物理位置：40718421，突变碱基T，参考碱基C；SNP98：9号染色体，物理位置：42281094，突变碱基C，参考碱基T；SNP99：9号染色体，物理位置：45228820，突变碱基G，参考碱基A；SNP100：9号染色体，物理位置：46041173，突变碱基T，参考碱基C；SNP101：9号染色体，物理位置：49977881，突变碱基A，参考碱基G；SNP102：9号染色体，物理位置：51221594，突变碱基C，参考碱基A；SNP103：9号染色体，物理位置：52937103，突变碱基A，参考碱基C；SNP104：9号染色体，物理位置：54545135，突变碱基G，参考碱基T；SNP105：9号染色体，物理位置：55063406，突变碱基A，参考碱基G；SNP106：9号染色体，物理位置：59678355，突变碱基A，参考碱基G；SNP107：9号染色体，物理位置：61404259，突变碱基C，参考碱基T；SNP108：9号染色体，物理位置：70127236，突变碱基G，参考碱基A；SNP109：9号染色体，物理位置：73030126，突变碱基A，参考碱基T；SNP110：9号染色体，物理位置：74796323，突变碱基C，参考碱基T；SNP111：9号染色体，物理位置：74895978，突变碱基T，参考碱基C；SNP112：9号染色体，物理位置：75838246，突变碱基G，参考碱基T；SNP113：9号染色体，物理位置：75862124，突变碱基C，参考碱基T；SNP114：9号染色体，物理位置：82416174，突变碱基A，参考碱基G；SNP115：9号染色体，物理位置：83792441，突变碱基C，参考碱基T；SNP116：9号染色体，物理位置：84036056，突变碱基G，参考碱基C；SNP117：9号染色体，物理位置：88930777，突变碱基C，参考碱基T；SNP118：9号染色体，物理位置：89129223，突变碱基G，参考碱基T；SNP119：9号染色体，物理位置：90508170，突变碱基G，参考碱基A；SNP120：9号染色体，物理位置：90563337，突变碱基A，参考碱基G；SNP121：9号染色体，物理位置：92959165，突变碱基G，参考碱基A；SNP122：9号染色体，物理位置：94501508，突变碱基A，参考碱基G；SNP123：9号染色体，物理位置：100616146，突变碱基G，参考碱基T；SNP124：9号染色体，物理位置：116734929，突变碱基G，参考碱基A；SNP125：9号染色体，物理位置：117648830，突变碱基A，参考碱基G；SNP126：9号染色体，物理位置：118567478，突变碱基G，参考碱基T；SNP127：10号染色体，物理位置：20492302，突变碱基T，参考碱基C；SNP128：10号染色体，物理位置：29215783，突变碱基A，参考碱基G；SNP129：10号染色体，物理位置：31788741，突变碱基A，参考碱基C；SNP130：10号染色体，物理位置：32935132，突变碱基C，参考碱基A；SNP131：10号染色体，物理位置：35409009，突变碱基A，参考碱基G；SNP132：10号染色体，物理位置：35551395，突变碱基A，参考碱基G；SNP133：10号染色体，物理位置：38184660，突变碱基C，参考碱基A；SNP134：10号染色体，物理位置：42791909，突变碱基T，参考碱基C；SNP135：10号染色体，物理位置：65593888，突变碱基A，参考碱基G；SNP136：11号染色体，物理位置：14862896，突变碱基T，参考碱基C；SNP137：11号染色体，物理位置：17138090，突变碱基G，参考碱基A；SNP138：11号染色体，物理位置：21702926，突变碱基T，参考碱基C；SNP139：11号染色体，物理位置：44099572，突变碱基C，参考碱基T；SNP140：11号染色体，物理位置：55501306，突变碱基C，参考碱基T；SNP141：11号染色体，物理位置：62685704，突变碱基A，参考碱基G；SNP142：12号染色体，物理位置：52051，突变碱基G，参考碱基C；SNP143：12号染色体，物理位置：1563196，突变碱基T，参考碱基C；SNP144：12号染色体，物理位置：3035683，突变碱基T，参考碱基C；SNP145：12号染色体，物理位置：3253584，突变碱基T，参考碱基C；SNP146：12号染色体，物理位置：7600063，突变碱基A，参考碱基G；SNP147：12号染色体，物理位置：22256486，突变碱基A，参考碱基G；SNP148：13号染色体，物理位置：6163406，突变碱基T，参考碱基C；SNP149：13号染色体，物理位置：7753218，突变碱基C，参考碱基T；SNP150：13号染色体，物理位置：155557314，突变碱基G，参考碱基A；SNP151：13号染色体，物理位置：160696289，突变碱基G，参考碱基C；SNP152：13号染色体，物理位置：171462604，突变碱基A，参考碱基T；SNP153：13号染色体，物理位置：200254878，突变碱基A，参考碱基T；SNP154：14号染色体，物理位置：2559046，突变碱基C，参考碱基A；SNP155：14号染色体，物理位置：4680078，突变碱基A，参考碱基G；SNP156：14号染色体，物理位置：34978595，突变碱基T，参考碱基C；SNP157：14号染色体，物理位置：46786260，突变碱基C，参考碱基T；SNP158：14号染色体，物理位置：108535483，突变碱基A，参考碱基G；SNP159：14号染色体，物理位置：108594591，突变碱基C，参考碱基A；SNP160：14号染色体，物理位置：125482014，突变碱基T，参考碱基C；SNP161：14号染色体，物理位置：126405693，突变碱基G，参考碱基A；SNP162：14号染色体，物理位置：133133953，突变碱基A，参考碱基C；SNP163：15号染色体，物理位置：28122738，突变碱基C，参考碱基T；SNP164：15号染色体，物理位置：59586440，突变碱基T，参考碱基G；SNP165：15号染色体，物理位置：60894229，突变碱基C，参考碱基G；SNP166：15号染色体，物理位置：73983888，突变碱基G，参考碱基A；SNP167：16号染色体，物理位置：538828，突变碱基A，参考碱基G；SNP168：16号染色体，物理位置：46509858，突变碱基C，参考碱基G；SNP169：16号染色体，物理位置：65062120，突变碱基G，参考碱基C；SNP170：17号染色体，物理位置：3133581，突变碱基T，参考碱基C；SNP171：17号染色体，物理位置：32845689，突变碱基T，参考碱基C；SNP172：17号染色体，物理位置：39502382，突变碱基A，参考碱基G；SNP173：17号染色体，物理位置：44257050，突变碱基G，参考碱基A；SNP174：17号染色体，物理位置：51981343，突变碱基A，参考碱基G；SNP175：17号染色体，物理位置：55699686，突变碱基T，参考碱基A；SNP176：17号染色体，物理位置：56857063，突变碱基T，参考碱基C；SNP177：18号染色体，物理位置：3150466，突变碱基A，参考碱基C；SNP178：18号染色体，物理位置：8577741，突变碱基A，参考碱基G；SNP179：18号染色体，物理位置：19144907，突变碱基C，参考碱基G；SNP180：18号染色体，物理位置：33829046，突变碱基A，参考碱基G；SNP181：18号染色体，物理位置：51085740，突变碱基T，参考碱基C；SNP182：18号染色体，物理位置：54063427，突变碱基T，参考碱基C。

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