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申请/专利权人：中国林业科学研究院亚热带林业研究所

摘要：本发明涉及一种快速鉴别茶梅品种的方法，本发明提供了自主开发的3对SSR标记引物SSR503、SSR528、SSR537，并将它们应用于茶梅品种鉴别。具体根据同一引物不同茶梅品种的SSR基因分型不同，鉴别不同品种。本发明得到的3对SSR引物均可以一次性将10个茶梅品种全部一一区分，鉴别效率高。与传统经验鉴别方法相比准确性高、可重复性强。与观测数据定性或者定量综合判定方法相比，能够节约时间和成本。因此，利用本方法对茶梅品种的鉴别具有广阔的应用前景，为茶梅品种有效识别及进一步开发利用提供技术支撑与科学依据。

主权项：1.一种鉴定茶梅品种的方法，其特征在于：使用SSRseqTM技术对茶梅品种进行快速鉴别，鉴别方法具体如下：DNA提取：使用DNA提取试剂盒提取茶梅品种新鲜叶片中的DNA；DNA质量评估：用琼脂糖凝胶电泳检查核酸的完整性，条带应清晰，无核酸降解和核酸污染，使用分光光度计评估脱氧核糖核酸纯度，DNA浓度≥20ngμL，含量≥200+n*30ngn为检测数；PCR扩增：用SSR503、SSR528和SSR537引物位点对10个茶梅品种进行单一或多重PCR反应扩增；所述10个茶梅品种分别为：大锦、大空、丁字车、幡罗桃、虹、花大臣、酒中花、镰仓绞、满月、七福神；所述SSR503引物，其上游引物的核苷酸序列如SEQIDNo.1所示，下游引物的核苷酸序列如SEQIDNo.2所示；所述SSR528引物，其上游引物的核苷酸序列如SEQIDNo.3所示，下游引物的核苷酸序列如SEQIDNo.4所示；所述SSR537引物，其上游引物的核苷酸序列如SEQIDNo.5所示，下游引物的核苷酸序列如SEQIDNo.6所示；高通量测序：将所有PCR产物汇集，并制备文库，在IlluminaHiSeq2500PE150bp平台上测序，对原始读数经过一系列分析，包括使用FastQC的质量控制、用FLASH对reads进行合并，使用Blastn构建参考比对；SSR基因分型：通过比对reads和序列数据计算SSR等位基因的数量，两步校正后列出了SSR基序和重复数，包括滑移调整和扩增效率调整；茶梅品种鉴别：根据同一引物不同茶梅品种的SSR基因分型不同，即可有效鉴别不同品种。

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权利要求：

百度查询： 中国林业科学研究院亚热带林业研究所 一种快速鉴别茶梅品种的SSR标记引物、方法及应用