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一种基于炭疽杆菌的微滴式数字PCR方法 

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申请/专利权人:山东省动物疫病预防与控制中心(山东省人畜共患病流调监测中心)

摘要:本申请涉数字PCR领域,提出了一种基于炭疽杆菌的微滴式数字PCR方法,包括:确定菌株和材料;基于炭疽标准菌株的全基因组序列设计基因的鉴定引物;提取炭疽杆菌基因组的DNA模版,基于用于DNA模版的反应体系生成微滴;基于PCR扩增中影响因素在不同约束条件下的荧光强度分布图中微滴的局部密度的分布均匀性确定气泡影响权重;基于每种升温速率下影响因素对应的微滴分类结果中阳性微滴与阴性微滴分离程度的近似程度确定气泡影响比例;基于气泡影响比例与气泡影响权重确定微滴校正模型;基于微滴校正模型对PCR扩增反应后所得微滴的校正结果完成定性定量分析。本方案降低气泡扩散对微滴的影响,提高定性定量分析结果的准确度。

主权项:1.一种基于炭疽杆菌的微滴式数字PCR方法,其特征在于,该方法包括以下步骤:确定用于炭疽杆菌ddPCR的菌株和材料;基于炭疽标准菌株str.AmesAncestor的全基因组序列设计基因的鉴定引物;提取炭疽杆菌基因组的DNA模版,基于用于所述DNA模版的反应体系生成微滴;基于PCR扩增中多种影响因素在不同约束条件下的荧光强度分布图中微滴的局部密度的分布均匀性确定每种影响因素的气泡影响权重;基于每种升温速率下每种影响因素对应的微滴分类结果中阳性微滴与阴性微滴分离程度的近似程度确定每种影响因素在每种升温速率下的气泡影响比例;基于所有影响因素在每种升温速率下的气泡影响比例以及所有影响因素的气泡影响权重确定每种升温速率下的微滴校正模型;基于微滴校正模型对PCR扩增反应的微滴进行校正,基于校正结果完成定性定量分析。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 山东省动物疫病预防与控制中心(山东省人畜共患病流调监测中心) 一种基于炭疽杆菌的微滴式数字PCR方法

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