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申请/专利权人:中南大学
摘要:本申请公开了一种多任务学习的IGVIntegrativeGenomicsViewer遗传结构变异图像识别方法、设备及介质,包括:根据原始结构变异检测VCF,VariantCallFormat文件,获取基因片段的IGV图像集;IGV图像集包括各基因片段对应的变异长度以及变异类型标签;通过光学字符识别OCR,OpticalCharacterRecognition技术识别变异类型标签为插入变异的IGV图像中的数字,对目标数字进行标记;将各IGV图像作为输入,IGV图像对应的变异类型标签作为输出,对预先构建的多任务网络模型进行训练;基于训练后的多任务网络模型对待分类IGV图像进行预测,待分类IGV图像是根据处理后VCF文件中的基因片段获取的。如此,能够提高对结构变异IGV图像的分类精度,有效解决软件对结构变异识别的真假阳性问题,降低人为筛查的主观性。
主权项:1.一种多任务学习的IGV遗传结构变异图像识别方法,其特征在于,包括:根据原始VCF文件中的多个基因片段获取对应的IGV图像集;IGV图像集包括各基因片段对应的IGV图像和各IGV图像对应的变异类型标签;通过OCR技术识别变异类型标签为插入变异的IGV图像中的数字,并对IGV图像中的目标数字进行标记;将各IGV图像作为输入,IGV图像对应的变异类型标签作为输出,对预先构建的多任务网络模型进行训练;基于训练后的多任务网络模型对待分类IGV图像进行预测,待分类IGV图像是根据处理后VCF文件中的基因片段获取的。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 中南大学 多任务学习的IGV遗传结构变异图像识别方法、设备及介质
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