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一种用于BCR基因重排检测的参考品及其制备方法和应用 

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申请/专利权人:迈杰转化医学研究(苏州)有限公司

摘要:本发明公开了一种用于BCR基因重排检测的参考品及其制备方法和应用。所述方法包括:取IgH、IgK和IgL重排组合不同的BCR基因样本,所述BCR基因样本选自肿瘤细胞系、肿瘤细胞系中基因组或人工合成的BCR基因;利用ddPCR对所述BCR基因样本中BCR基因进行定量,得到各BCR基因样本中BCR基因的拷贝数,按检测需求的BCR基因的拷贝数比例,将各BCR基因样本混合,即得到所述用于BCR基因重排检测的参考品。本发明制备的BCR基因重排检测的参考品,可用于对基于高通量测序的BCR重排的检测结果进行质量评估,开展不同测序平台、检测流程、取样方式间结果的对比,便于制定BCR重排检测技术标准。

主权项:1.一种用于BCR基因重排检测的参考品的制备方法,其特征在于,所述制备方法包括:取29种BCR基因IgH、IgK和IgL重排组合不同的BCR基因样本,所述BCR基因样本为人工合成的BCR基因;利用ddPCR对所述29种BCR基因样本中BCR基因进行定量,得到各BCR基因样本中BCR基因的拷贝数,将29个线性DNA产物按照等比例混合,即得到所述用于BCR基因重排检测的参考品;所述BCR基因样本为IGHV3-11*06基因、IGHV3-53*01基因、IGHV3-25*01基因、IGHV3-21*06基因、IGHV3-64*02基因、IGHV3-23*02基因、IGHV3-73*01基因、IGHV3-23*01基因、IGHV3-64*01基因、IGHV1-8*01基因、IGHV4-28*01基因、IGHV6-1*01基因、IGKV1-12*01基因、IGKV1-27*01基因、IGKV1-5*01基因、IGKV1D-13*01基因、IGKV1D-33*01基因、IGKV1-NL1*01基因、IGKV2D-40*01基因、IGKV5-2*01基因、IGKV6-21*01基因、IGLV1-47*02基因、IGLV2-11*01基因、IGLV3-25*02基因、IGLV10-54*02基因、IGLV8-61*01基因、IGLV6-57*02基因、IGLV4-60*03基因和IGLV3-25*02基因的组合;所述IGHV3-11*06基因的核酸序列如SEQIDNO.19所示,所述IGHV3-53*01基因的核酸序列如SEQIDNO.20所示,所述IGHV3-25*01基因的核酸序列如SEQIDNO.21所示,所述IGHV3-21*06基因的核酸序列如SEQIDNO.22所示的序列,所述IGHV3-64*02基因的核酸序列如SEQIDNO.23所示,所述IGHV3-23*02基因的核酸序列如SEQIDNO.24所示,所述IGHV3-73*01基因的核酸序列如SEQIDNO.25所示,所述IGHV3-23*01基因的核酸序列如SEQIDNO.26所示,所述IGHV3-64*01基因的核酸序列如SEQIDNO.27所示,所述IGHV1-8*01基因的核酸序列如SEQIDNO.28所示,所述IGHV4-28*01基因的核酸序列如SEQIDNO.29所示,所述IGHV6-1*01基因的核酸序列如SEQIDNO.30所示,所述IGKV1-12*01基因的核酸序列如SEQIDNO.31所示,所述IGKV1-27*01基因的核酸序列如SEQIDNO.32所示,所述IGKV1-5*01基因的核酸序列如SEQIDNO.33所示,所述IGKV1D-13*01基因的核酸序列如SEQIDNO.34所示,所述IGKV1D-33*01基因的核酸序列如SEQIDNO.35所示,所述IGKV1-NL1*01基因的核酸序列如SEQIDNO.36所示,所述IGKV2D-40*01基因的核酸序列如SEQIDNO.37所示,所述IGKV5-2*01基因的核酸序列如SEQIDNO.38所示,所述IGKV6-21*01基因的核酸序列如SEQIDNO.39所示,所述IGLV1-47*02基因的核酸序列如SEQIDNO.40所示,所述IGLV2-11*01基因的核酸序列如SEQIDNO.41所示,所述IGLV3-25*02基因的核酸序列如SEQIDNO.42所示,所述IGLV10-54*02基因的核酸序列如SEQIDNO.43所示,所述IGLV8-61*01基因的核酸序列如SEQIDNO.44所示,所述IGLV6-57*02基因的核酸序列如SEQIDNO.45所示,所述IGLV4-60*03基因的核酸序列如SEQIDNO.46所示和所述IGLV3-25*02基因的核酸序列如SEQIDNO.47所示。

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权利要求:

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