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一种基于分子指纹比较的肿瘤新抗原鉴定方法 

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申请/专利权人:华南理工大学

摘要:本发明公开了一种基于分子指纹比较的肿瘤新抗原鉴定方法。传统肿瘤新抗原鉴定均未考虑多肽分子指纹对突变肽免疫原性的影响,与之相比,本发明所述方法充分利用多肽的分子指纹信息,可显著过滤掉无免疫原性的突变肽,提高肿瘤新抗原预测的准确率;本发明所述方法可以为肿瘤疫苗和肿瘤细胞疗法提供精准的肿瘤新抗原靶标。

主权项:1.一种基于分子指纹比较的肿瘤新抗原鉴定方法,其特征在于包括如下步骤:1对肿瘤样本进行全基因组测序,并与人类参考基因组进行对比,检测样本中的突变,以突变位点为中心,生成作为候选新抗原的突变肽和野生肽;2根据肿瘤样本对应分型的HLA分子的氨基酸序列和步骤1得到的突变肽和野生肽的氨基酸序列,通过多肽三维结构预测模型计算得到与HLA分子结合的多肽分子的三维结构数据;3根据步骤2得到的突变肽野生肽的三维结构数据,计算其分子指纹,并计算两组分子指纹的差异,得到一组数值向量;4根据步骤3得到的数值向量,通过免疫原性预测模型计算突变肽的免疫原性得分,根据得分判断突变肽是否具有免疫原性。

全文数据:

权利要求:

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