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鉴定肿瘤病变中功能性基因组非编码区域及其作用靶点和机制的系统及计算机设备 

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申请/专利权人:浙江大学

摘要:本发明提供一种鉴定肿瘤病变中功能性基因组非编码区域及其作用靶点和机制的系统,其包括数据库单元和整合分析单元。数据库单元内的样本收集模块收集多种类型的癌症样本并获取每一癌症样本的多组学数据;数据预处理模块预处理每一组学数据,并以正常样本作为对照组确定每一样本组学数据中的差异特征信息以形成样本的功能性基因组非编码区域。整合分析单元基于输入的待分析基因组区域和癌症类型检索数据库以鉴定功能性基因组非编码区域并进行多组学特征注释;采用多组学整合策略整合功能性基因组非编码区域内所有组学数据的差异特征信息,获取所有组学数据均包含的共同差异特征信息并确定受多组学共同调控的靶向基因、相关基因或调控区域。

主权项:1.一种鉴定肿瘤病变中功能性基因组非编码区域及其作用靶点和机制的系统,其特征在于,包括:数据库单元,包括样本收集模块和数据预处理模块,所述样本收集模块收集多种类型的癌症样本并获取每一癌症样本的多组学数据;所述数据预处理模块预处理每一癌症样本内的每一组学数据,并以正常样本作为对照组进行比对,确定每一样本组学数据中的差异特征信息以形成样本的功能性基因组非编码区域,所述差异特征信息包括差异表达基因、差异性环路以及差异信号峰;整合分析单元,基于用户输入的待分析基因组区域和癌症类型检索数据库以鉴定功能性基因组非编码区域并多组学特征注释所述功能性基因组非编码区域;采用多组学整合策略整合功能性基因组非编码区域内所有组学数据的差异特征信息,获取所有组学数据均包含的共同差异特征信息并基于该共同差异特征信息在功能性基因组非编码区域内确定受多组学共同调控的靶向基因、相关基因或调控区域。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 浙江大学 鉴定肿瘤病变中功能性基因组非编码区域及其作用靶点和机制的系统及计算机设备

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