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一种提高CRISPR/Cas基因编辑效率的方法 

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申请/专利权人:大连理工大学

摘要:本发明公开了一种提高CRISPRCas基因编辑效率的方法,属于基因工程技术领域。首先将pCas质粒及pTox质粒转入宿主菌,pCas质粒中插入有Cas基因和lambdaRed基因,pTox质粒中插入有毒性基因,再将pgRNA质粒与外源DNA共同转入上述宿主菌,pgRNA质粒中插入有靶向目标基因gRNA_1和靶向pTox质粒的抗性基因的gRNA_2;pCas质粒表达的Cas蛋白与pgRNA质粒转录的gRNA_1组合对目标靶向位点进行DNA剪切,lambdaRed系统结合外源DNA实现基因重组,Cas蛋白与gRNA_1组合后未对目标靶向位点进行DNA剪切,宿主菌中pTox质粒表达有毒物质,从而去除未经基因编辑的宿主菌,保留经基因编辑的宿主菌。此方法不仅可提高单个靶向位点的基因编辑效率,也能提高基因敲除、大片段DNA插入及重组效率,提高高通量基因编辑的效率。

主权项:1.一种提高CRISPRCas基因编辑效率的方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)将pCas质粒及pTox质粒转入宿主菌中,所述的pCas质粒中插入有Cas基因和lambdaRed系统基因,所述的pTox质粒中插入有毒性基因;(2)再将pgRNA质粒与外源DNA转入步骤(1)得到的宿主菌中,pgRNA质粒中插入有靶向目标基因gRNA_1和靶向pTox质粒的毒性基因的gRNA_2,gRNA_2的前端插入有SOS响应基因启动子,SOS响应基因启动子由pCas质粒表达的Cas蛋白与pgRNA质粒转录的gRNA_1组合后对目标靶向位点进行DNA剪切来启动;(3)pCas质粒表达的Cas蛋白与pgRNA质粒转录的gRNA_1组合对目标靶向位点进行DNA剪切,pCas质粒表达的lambdaRed系统结合外源DNA实现基因重组,在培养过程中去除未经基因编辑的宿主菌,保留经基因编辑的宿主菌;步骤(1)中所述的宿主菌为大肠杆菌;步骤(1)中所述的Cas为Cas9、AsCas12a、LbCas12a、MAD7或FnCas12a;步骤(1)中所述的毒性基因为硝基还原酶基因nfsI或果聚糖蔗糖转移酶基因sacB;步骤(2)中所述的gRNA_2的核苷酸序列如SEQIDNO.5或SEQIDNO.6所示;步骤(2)中SOS响应基因为recA、uvrD、recG、rnhA、dam、xerC、ftsK、priA、dnaT、polA或lexA。

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