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一种基于神威超级计算机的AztecOO移植优化方法及系统 

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申请/专利权人:齐鲁工业大学(山东省科学院);山东省计算中心(国家超级计算济南中心)

摘要:本发明涉及电子信息技术领域,提供了一种基于神威超级计算机的AztecOO移植优化方法及系统。该方法包括,将Epetra和AztecOO移植到新一代神威超级计算机的主核上;基于移植后主程序的计算热点,采用手动插桩的方式,在主程序内部进行细粒度热点分析,找到计算密集函数,计算密集函数为CSR格式的稀疏矩阵向量乘的子程序;将所述子程序中假定大小数组格式改为固定内存分配方式,调整数组的具体大小;将所述稀疏矩阵中的数据按行等分,平均分配给所有从核,以使从核对分配的数据进行线程级并行计算,达到所述从核能同时完成数据计算的目的;从访存速度和访存带宽两方面进行了从核访存优化,提高了带宽利用率和访存效率,极大提升了程序计算性能。

主权项:1.一种基于神威超级计算机的AztecOO移植优化方法,其特征在于,包括:将Epetra和AztecOO移植到新一代神威超级计算机的主核上;基于移植后主程序的计算热点,采用手动插桩的方式,在主程序内部进行细粒度热点分析,找到计算密集函数,所述计算密集函数为CSR格式的稀疏矩阵向量乘的子程序;将所述子程序中假定大小数组格式改为固定内存分配方式,调整数组的具体大小;将所述稀疏矩阵中的数据按行等分,平均分配给所有从核,以使从核对分配的数据进行线程级并行计算,达到所述从核能同时完成数据计算的目的;采用神威众核处理器的共享LDM机制,从一个核组内所有从核的LDM中各自分割出预设存储空间,形成共享空间,每个从核直接访问所述共享空间;在从核与主核之间采用Athread加速线程库中的直接内存存取方式进行数据批量传输。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 齐鲁工业大学(山东省科学院) 山东省计算中心(国家超级计算济南中心) 一种基于神威超级计算机的AztecOO移植优化方法及系统

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