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基因重组状态判断方法、整合位点筛选方法及系统 

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申请/专利权人:深圳太力生物技术有限责任公司

摘要:本发明公开了一种基于图像的基因重组状态判断方法,对于重组前目标载体微粒或重组后目标载体微粒含有荧光蛋白报告基因的基因重组过程的重组状态进行判断。本发明对重组后的表达载体进行成像,分析荧光蛋白报告基因在表达载体内部和表达载体以外的背景中的表达强度,体现了荧光蛋白报告基因或外源目的基因在表达载体上的表达和在表达载体不同部位的迁移状态,从而可用于判断重组后荧光蛋白报告基因或外源目的基因在表达载体基因组上的表达能力、基因组稳定性、传代稳定性等基因重组状态,应用于整合位点筛选,能缩短对重组后基因组状态的观察时间,更高效迅速的筛选出对外源目的基因具有适应性更好的细胞株或其他表达载体,节省人力物力。

主权项:1.一种基于图像的基因重组状态判断方法,其特征在于,对于重组前目标载体微粒或重组后目标载体微粒含有荧光蛋白报告基因的基因重组过程的重组状态进行判断,包括以下步骤:1对所述基因重组过程的任一环节的载体微粒培养集群进行明场成像和荧光成像,获取载体微粒培养集群的明场图像和荧光图像;2对于步骤1获得的载体微粒培养集群图像,采用图像法区分载体微粒培养集群内载体微粒个体以及载体微粒以外的背景,并检测背景以及载体微粒个体的荧光信号的强度;3根据步骤2获得的背景以及各个载体微粒个体的荧光信号的强度,以载体微粒集群的荧光信号强度和或其平均值相对于背景荧光信号强度的差异程度作为重组状态判断指标;4以步骤3计算得到的重组状态判断指标在所述基因重组过程中的变化判断重组状态。

全文数据:

权利要求:

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