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基于甲基化测序数据的CRC筛查系统 

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申请/专利权人:达州市中心医院(达州市人民医院)

摘要:本发明涉及数据处理技术领域,提供基于甲基化测序数据的CRC筛查系统,从目标对象在不同时期的若干结肠或直肠样本对应的甲基化测序数据筛选得到有效甲基化测序数据集合,转换得到肿瘤微卫星状态数据;对肿瘤微卫星状态数据进行时域演变分析,得到肿瘤微卫星分布演变信息,构建每个时期的肿瘤微卫星状态知识图谱,对肿瘤微卫星进行全局化图谱表征;基于目标对象最新的结肠或直肠样本的甲基化测序数据,更新存储的知识图谱数据;基于提取的肿瘤微卫星状态知识图谱的图谱元素内容属性信息,确定匹配的神经网络模型,得到目标对象的结肠或直肠癌变趋势信息,确定目标对象定点筛查的执行信息,利用有限的样本甲基化测序数据实现全局化的CRC筛查。

主权项:1.基于甲基化测序数据的CRC筛查系统,其特征在于,其包括如下步骤:甲基化测序数据初步处理模块,用于获取目标对象在不同时期的若干结肠或直肠样本各自对应的甲基化测序数据,对所有甲基化测序数据分别进行预筛选,得到有效甲基化测序数据集合;数据转换模块,用于对所述有效甲基化测序数据集合进行转换,得到所述目标对象的肿瘤微卫星状态数据;数据时域演变分析模块,用于对所述肿瘤微卫星状态数据进行时域演变分析,确定所述目标对象在不同时期对应的肿瘤微卫星分布演变信息;知识图谱构建模块,用于基于所述肿瘤微卫星分布演变信息,构建所述目标对象在每个时期的肿瘤微卫星状态知识图谱;数据更新模块,用于对所述肿瘤微卫星状态知识图谱进行时间属性标识后存储至数据区块链中,并基于对所述目标对象最新的结肠或直肠样本的甲基化测序数据,对所述数据区块链进行数据更新;神经网络模型确定模块,用于从所述数据区块链提取满足预设图谱元素状态条件的肿瘤微卫星状态知识图谱,并基于提取的肿瘤微卫星状态知识图谱的图谱元素内容属性信息,确定相匹配的神经网络模型;知识图谱分析模块,用于基于所述相匹配的神经网络模型,对提取的肿瘤微卫星状态知识图谱进行分析,得到所述目标对象的结肠或直肠癌变趋势信息;CRC预测定位模块,用于基于所述结肠或直肠癌变趋势信息,确定对所述目标对象进行定点筛查的执行信息。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 达州市中心医院(达州市人民医院) 基于甲基化测序数据的CRC筛查系统

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