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一种基于酶促重组等温扩增检测粪便SFRP2、SEPTIN9 DNA甲基化与具核梭杆菌核酸的微流控测试方法 

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申请/专利权人:重庆市江津区中心医院

摘要:本发明公开了一种基于酶促重组等温扩增检测粪便SFRP2、SEPTIN9DNA甲基化与具核梭杆菌核酸的微流控测试方法,核心在于将ERA‑Cas12a技术结合微流控芯片技术应用于粪便样本SFRP2、SEPTIN9甲基化与具核梭杆菌。ERA‑Cas12a是一种新型的核酸酶,具有高度的特异性和灵敏性,能够在等温条件下实现核酸的快速扩增和检测。通过巧妙地设计特异性引物,本发明使得这些引物能够同时符合甲基化和ERA‑Cas12a技术的要求,从而确保了检测的高效性和准确性。利用微流控技术进行粪便SFRP2、SEPTIN9甲基化与具核梭杆菌核酸,简化了甲基化处理流程,并且让检测结果判读直观简单。

主权项:1.一种基于酶促重组等温扩增检测粪便SFRP2、SEPTIN9DNA甲基化与具核梭杆菌核酸的微流控测试方法,其特征在于:包括以下步骤,S1、样本处理,收集粪便样本,通过加热裂解、磁珠吸附、洗涤、洗脱得到扩增产物;S2、核酸甲基化,将磁棒取出放入有洗脱液的自热管中,温度达到95℃,变性5min,使DNA变为单链,再次用新的磁棒吸附洗脱液,将磁棒放入有亚硫酸氢盐的处理管中16h,最后通过洗涤、洗脱,得到甲基化处理后的核酸;S3、引物设计,设计SFRP2和SEPTIN9的甲基化、非甲基化的引物,设计F.nucleatum引物,其中SFRP2的甲基化、非甲基化的引物序列如表1,表1.SFRP2甲基化、非甲基化引物 SEPTIN9的甲基化和非甲基化引物序列如表2,表2.SEPTIN9甲基化、非甲基化引物 F.nucleatum引物序列如表3,表3.F.nucleatum引物 S4、探针设计与筛选,其中SFRP2甲基化引物探针:5'TTGTGTGTTAGAGTTCGTGATGTTTTCGAGTATTGAGTTATGTTATT3';SEPTIN9甲基化引物探针:5'GAGGGGAAGAGGAGGAGGATTTTTCGGGGTTGTTAGTGATATTTTT3';F.nucleatum引物探针:5'AATGGAAGCTACAAGAGAAGAAAATGAAAATGGTATAAGTTATAAAG3';S5、微流控芯片设计,芯片包括通过孔径0.2cm的管道连通的加样区、ERA扩增区、CRISPR-Cas12a反应区、侧向流结果判读区,其中CRISPR-Cas12a检测区包被有相应的荧光探针;S6、核酸扩增:ERA扩增区分别将筛选后的甲基化SFRP2、SEPTIN9特异性引物与甲基化处理后的核酸,以及具核梭杆菌特异引物与其核酸,利用ERA酶在等温条件下进行快速扩增反应;S7、侧向流试纸条:采用了FAMFITC-生物素报告基因进行免疫层析检测,阳性样品中,金粒抗生物素抗体与高浓度FAMFITC-生物素报告基因充分结合,结合物在检测条带T线被抗FAMFITC抗体拦截,形成显色条带;阴性样本,无完整的FAMFITC-生物素报告基因,金粒抗生物素抗体形成不能被检测条带T线拦截,无显示条带。

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