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胃癌亚型的分类及其应用 

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申请/专利权人:福州大彻精准医学科技有限公司

摘要:本发明公开胃癌亚型的分类及其应用,在收集胃癌患者的基因表达数据的基础上,采用ComBat去除批次效应并使用非监督类聚类分析方法得到胃癌的病人的四种亚型,包括间质型、免疫型、经典型和代谢型;不同分型的胃癌病人对PD1免疫药物和化疗药物有不同的反应,间质型胃癌病人显著受益于抗血管生成药物;免疫分型预测胃癌病人对PD1免疫药物的反应优于传统的生物标志物:包括微卫星不稳定,EBV病毒,PD‑L1CPS表达和肿瘤突变负荷;经典型胃癌病人显著受益于细胞周期抑制剂;代谢型病人显著受益于5‑氟尿嘧啶+铂类;根据这四种类型采用合适的药物将极大的提高胃癌病人的生存率,尽量避免不适用药物,这样会减小化疗的毒性和副作用。

主权项:1.胃癌亚型的分类方法,其特征在于:收集胃癌患者的基因表达数据,采用ComBat去除批次效应并使用非监督类聚类分析方法得到胃癌的病人的四种亚型,包括间质型、免疫型、经典型和代谢型;其中,用于特异性识别所述间质型胃癌的基因指纹图谱包括表1A中序号1-10所示的基因,用于特异性识别所述免疫型胃癌的基因指纹图谱包括表1B中序号1-10所示的基因,用于特异性识别所述经典型胃癌的基因指纹图谱包括表1C中序号1-10所示的基因,用于特异性识别所述代谢型胃癌的基因指纹图谱包括表1D中序号1-10所示的基因;表1A间质型胃癌患者基因指纹谱 序号 探针标记 基因 1 243041_s_at RBMS3 2 1556325_at FILIP1 3 235723_at BNC2 4 227657_at RNF150 5 224184_s_at BOC 6 224339_s_at ANGPTL1 7 1553194_at NEGR1 8 213306_at MPDZ 9 208561_at ABCC9 10 227526_at CDON 表1B免疫型胃癌患者基因指纹谱 序号 探针标记 基因 1 205044_at GABRP 2 210029_at IDO1 3 205242_at CXCL13 4 238017_at SDR16C5 5 220351_at CCRL1 6 230069_at SFXN1 7 217886_at EPS15 8 226957_x_at RALBP1 9 218491_s_at THYN1 10 221816_s_at PHF11 表1C经典型胃癌患者基因指纹谱 表1D代谢型胃癌患者基因指纹谱 序号 探针标记 基因 1 241640_at BCAP29 2 233483_at TBC1D27 3 244409_at CCDC154 4 211693_at IGHG1 5 220923_s_at PNMA3 6 236286_at PROCA1 7 235595_at ARHGEF2 8 220714_at PRDM14 9 239996_x_at ATP2A2 10 226903_s_at SLC6A10P 。

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