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一种基于实时荧光定量PCR评估香蕉内源性BSV激活积累量的方法 

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申请/专利权人:华南农业大学

摘要:本发明公开一种基于实时荧光定量PCR评估香蕉内源性BSV激活积累量的方法,属于香蕉病毒检测技术领域。通过该方法可以准确评估内源性BSV如BSOLV的激活积累量。该方法适用于生物胁迫和非生物胁迫情况下,评估B基因组香蕉中内源性BSV如BSOLV的激活积累量,为利用内源性BSV如BSOLV的激活积累量来预测香蕉线条病的发生和流行提供科学依据,以采取防控措施阻断香蕉线条病的流行。该方法的优点在于,不局限于香蕉中B基因的倍数评估内源性BSV如BSOLV的激活积累量,为准确预测内源性BSV如BSOLV激活引起的香蕉线条病的流行奠定了基础。

主权项:1.一种基于SYBRGreenⅠ实时荧光定量PCR评估香蕉内源性BSV激活积累量的方法,其特征在于:包括如下步骤:1提取B基因组香蕉的DNA;2以含有BSV阳性植株提取的DNA为模板,根据BSV的保守序列设计引物,经PCR扩增,获得扩增产物;根据PCR扩增产物构建质粒标准品;3以质粒标准品为模板进行PCR扩增,筛选SYBRGreenⅠ实时荧光定量PCR引物;以确定适宜的实时荧光定量PCR引物;4利用步骤3筛选的引物,通过对引物浓度以及退火温度进行实时荧光定量PCR筛选,以确定SYBRGreenⅠ实时荧光定量PCR引物浓度和退火温度;然后,以步骤2的质粒标准品为模板,利用筛选得到的SYBRGreenⅠ实时荧光定量PCR引物、引物浓度和退火温度进行qPCR扩增,以质粒DNA拷贝数的对数值为横坐标,Ct值为纵坐标,建立标准曲线;5以B基因组香蕉的DNA为模板,利用筛选得到的SYBRGreenⅠ实时荧光定量PCR引物、引物浓度和退火温度进行qPCR扩增,并通过步骤4建立的标准曲线计算出B基因组香蕉中的BSV拷贝数,作为BSV初始拷贝数;6一段时间后,以相同基因型的B基因组香蕉的DNA为模板,利用筛选得到的SYBRGreenⅠ实时荧光定量PCR引物、引物浓度和退火温度进行qPCR扩增,并通过步骤4建立的标准曲线计算出相同基因型的B基因组香蕉中的BSV拷贝数,作为BSV测定拷贝数;7步骤6的BSV测定拷贝数与步骤5的BSV初始拷贝数之差,即为该段时间内B基因组香蕉中内源性BSV的激活积累量。

全文数据:

权利要求:

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