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申请/专利权人：烟台国工智能科技有限公司
摘要：基于构象及力场的小分子过渡态初始结构生成方法及装置，该方法根据输入分子中原子的键连接关系，通过分子结构生成策略，生成输入分子的初始构象并进行结构优化；对输入分子进行旋转平移，确定相对朝向，完成拼接结构的初始化；计算获得输入分子的转动惯量和总质量；计算获得若干输入分子的原子之间的相互作用力和拼接位点之间的相互作用力；将输入分子中每个原子受到的作用力，分解为穿过输入分子质心的力和力矩；计算获得输入分子的平动位移和转动位移，并更新输入分子中原子的坐标；通过迭代计算更新，输出若干输入分子拼接后的最终结构。本发明能够在拼接过程中能够有效避免原子重叠问题，并确保所选择的拼接位点保持在最短距离。
主权项：1.基于构象及力场的小分子过渡态初始结构生成方法，其特征在于，包括：通过输入的SMILES确定输入分子中原子的键连接关系；根据输入分子中原子的所述键连接关系，通过分子结构生成策略，生成输入分子的初始构象；通过基于能量的优化算法对输入分子的所述初始构象进行结构优化；根据输入分子中原子的电荷信息或输入分子表面静电势的电荷信息，确定输入分子之间互相吸引的位置；根据输入分子之间互相吸引的位置，对输入分子进行旋转平移，确定输入分子的相对朝向，完成输入分子拼接结构的初始化；通过设定计算策略，计算获得输入分子的转动惯量和总质量；根据原子之间的相互作用势及拼接位点之间的相互作用势，计算获得若干输入分子的原子之间的相互作用力和若干输入分子的拼接位点之间的相互作用力；将输入分子中每个原子受到的所述原子之间的相互作用力，分解为穿过输入分子质心的力和力矩；根据所述穿过输入分子质心的力和力矩，计算获得输入分子的平动位移和转动位移；根据输入分子的所述平动位移及所述转动位移更新输入分子中原子的坐标；根据更新后的输入分子中原子的坐标，进行迭代计算更新，直至达到计算上限或若干输入分子的拼接位点之间的距离满足设定值，停止迭代计算更新，并输出若干输入分子拼接后的最终结构。
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百度查询： 烟台国工智能科技有限公司 基于构象及力场的小分子过渡态初始结构生成方法及装置
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