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用于抑制接头二聚体形成的方法、组合物和试剂盒专利

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申请/专利权人:柏尔科学公司

申请日:2023-03-24

公开(公告)日:2025-01-17

公开(公告)号:CN119325511A

专利技术分类:..·制备用于分析的核酸,例如用于聚合酶链式反应[PCR]分析( C12Q 1/6804 优先)[2018.01]

专利摘要:根据本公开内容的方面,提供了减少测序文库中接头‑二聚体的方法,其包括:使过量的3'接头与阻断剂寡核苷酸杂交以形成杂交复合体,使得过量的3'接头不能形成接头‑二聚体,所述杂交复合体包括:第一阻断剂寡核苷酸3'端,其与第一未连接的3'接头的5'端处的腺苷酸化核苷酸相邻,和第二阻断剂寡核苷酸3'端,其与第二未连接的3'接头的5'端处的腺苷酸化核苷酸相邻,其中第一阻断剂寡核苷酸具有与第一未连接的3'接头互补并杂交的5'部分,第二阻断剂寡核苷酸具有与第二未连接的3'接头互补并杂交的5'部分,和第一阻断剂寡核苷酸具有与第二阻断剂寡核苷酸的3'部分互补并杂交的3'部分。第一和第二阻断剂寡核苷酸可能是相同的寡核苷酸,其包括允许自杂交的回文序列。

专利权项:1.一种在测序文库中减少接头-二聚体的方法,包括:在连接反应条件下的混合物中,将各自具有5’末端和3’末端的样品核酸与3’接头和连接酶结合,所述3’接头各自具有长度为至少8个核苷酸的5’末端部分和一个为腺苷酸化核苷酸的5’端,产生1第一连接产物,其各自包括连接至3’接头的5’端的样品核酸的3’末端,和2混合物中过量的未连接的3’接头;向所述混合物中加入阻断剂寡核苷酸,所述阻断剂寡核苷酸包括:a第一阻断剂寡核苷酸,其包括:i第一阻断剂寡核苷酸5’部分,其长度为至少8个核苷酸,和ii第一阻断剂寡核苷酸3’部分,其长度为至少1至20个核苷酸,并包括第一寡核苷酸3’端,其中所述1至20个核苷酸中的至少1个为非天然存在的核苷酸;和b第二阻断剂寡核苷酸,其包括:iii第二寡核苷酸5’部分,其长度为至少8个核苷酸,和iv第二阻断剂寡核苷酸3’部分,其长度为至少1至20个核苷酸,并包括第二阻断剂寡核苷酸3’端,其中所述1至20个核苷酸中的至少1个是非天然存在的核苷酸;其中所述第一阻断剂寡核苷酸3'部分和所述第二阻断剂寡核苷酸3'部分长度相等且彼此互补;其中所述第一阻断剂寡核苷酸5'部分和所述第二阻断剂寡核苷酸5'部分均与所述3'接头的5'末端部分互补;在杂交条件下孵育混合物,从而使第一阻断剂寡核苷酸3’部分与第二阻断剂寡核苷酸3’部分杂交,使第一阻断剂寡核苷酸5’部分与过量的未连接的3’接头杂交,并从而使第二阻断剂寡核苷酸5’部分与过量的未连接的3’接头杂交,产生杂交复合体,其中第一阻断剂寡核苷酸3’端与第一未连接的3’接头的腺苷酸化5’末端核苷酸相邻,且第二阻断剂寡核苷酸3’端与第二未连接的3’接头的腺苷酸化5’末端核苷酸相邻,从而减少混合物中过量的未连接的3’接头,产生纯化的混合物。

百度查询: 柏尔科学公司 用于抑制接头二聚体形成的方法、组合物和试剂盒

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