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申请/专利权人:广西大学
摘要:本发明公开了南丹瑶鸡蛋壳厚度、蛋壳强度和蛋形指数关联SNP分子标记的筛选方法:1取南丹瑶鸡,采血提基因组DNA,测序,检测在南丹瑶鸡上存在突变SNP位点的基因;2取南丹瑶鸡母鸡作为试验鸡,测定鸡蛋的蛋壳厚度、蛋壳强度和蛋形指数形状指标;3提取基因组DNA,对步骤1检测到的SNP位点进行多重PCR测序,收集试验鸡在SNP位点的基因型信息;4整理测序数据和蛋壳厚度、蛋壳强度和蛋形指数数据,筛选出与蛋壳厚度、蛋壳强度和蛋形指数极显著PrF0.01关联的候选SNP分子标记。本发明简化了操作步骤,适用于高遗传力的数量性状的选育,筛选后提高鸡蛋抵抗破损能力,便于运输。
主权项:1.一种11个SNP位点在制备试剂盒或检测方法中的应用,其特征在于:所述试剂盒或检测方法的用途为用于南丹瑶鸡鸡蛋壳厚度、蛋壳强度和蛋形指数关联的性状辅助育种;其中,所述11个SNP分子标记为chr9_4769768、chr9_4771619、chr9_4771623、chr9_4771738、chr9_4771779、chr9_4772495、chr4_16561900、chr4_16561922、chr12_3351761、chr1_65234336、chr1_65234317与产蛋周期蛋壳厚度、蛋壳强度和蛋形指数关联;所述chr9_4769768位点位于SEQIDNO:1所示的核苷酸序列的第101位,该位置处有TT、TC、CC三种基因型,其中TC型个体的鸡蛋蛋壳厚度最厚、蛋壳强度最强,TC型个体的鸡蛋蛋形指数最佳;所述chr9_4771619位点位于SEQIDNO:2所示的核苷酸序列的第101位,该位置处有TT、TC两种基因型,其中TT型个体的鸡蛋蛋壳厚度最厚;所述chr9_4771623位点位于SEQIDNO:3所示的核苷酸序列的第101位,该位置处有CC、CA两种基因型,其中CC型个体的鸡蛋蛋壳厚度最厚;所述chr9_4771738位点位于SEQIDNO:4所示的核苷酸序列的第101位,该位置处有GG、GA两种基因型,其中GG型个体的鸡蛋蛋壳厚度最厚;所述chr9_4771779位点位于SEQIDNO:5所示的核苷酸序列的第101位,该位置处有AA、AG两种基因型,其中AA型个体的鸡蛋蛋壳厚度最厚;所述chr9_4772495位点位于SEQIDNO:6所示的核苷酸序列的第101位,该位置处有CC、CT两种基因型,其中CC型个体的鸡蛋蛋壳厚度最厚;所述chr4_16561900位点位于SEQIDNO:7所示的核苷酸序列的第101位,该位置处有CC、CG、GG三种基因型,其中GG型个体的鸡蛋蛋壳厚度最厚;所述chr4_16561922位点位于SEQIDNO:8所示的核苷酸序列的第101位,该位置处有GG、GA、AA三种基因型,其中AA型个体的鸡蛋蛋壳厚度最厚;所述chr12_3351761位点位于SEQIDNO:9所示的核苷酸序列的第101位,该位置处有CC、CT、TT三种基因型,其中TT型个体的鸡蛋蛋壳强度最强;所述chr1_65234336位点位于SEQIDNO:10所示的核苷酸序列的第101位,该位置处有CC、CT、TT三种基因型,其中CC型个体的鸡蛋蛋壳强度最强;所述chr1_65234317位点位于SEQIDNO:11所示的核苷酸序列的第101位,该位置处有AA、AG两种基因型,其中AG型个体的鸡蛋蛋壳强度最强。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 广西大学 南丹瑶鸡蛋壳厚度、蛋壳强度和蛋形指数关联SNP分子标记的筛选方法及用途
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