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一种用于获取植物叶肉细胞染色质构象信息的方法及试剂盒 

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申请/专利权人:中国农业科学院蔬菜花卉研究所

摘要:本发明公开一种用于获取植物叶肉细胞染色质构象信息的方法及试剂盒,该方法包括取植物叶肉细胞在交联缓冲液中进行处理,然后经研磨、过滤得到细胞核;将细胞核经通透处理后加入酶切反应液,得到平末端DNA序列,进一步进行加尾反应;加入连接反应体系,完成反应后加入外切酶处理;解交联后纯化DNA进行测序。本发明的方法简化了细胞核的提取步骤,并且只需要一轮消化和连接就可以完成主要实验。此外,本发明的方法与传统高通量染色质构象捕获技术相比信号值更高,背景噪音也更低,这增强了其检测染色质相互作用的可靠性和准确性。

主权项:1.一种用于获取植物叶肉细胞染色质构象信息的方法,其特征在于,包括以下步骤:1取植物叶肉细胞在交联缓冲液中进行处理,然后经研磨、过滤得到细胞核;2将细胞核经通透处理后加入酶切反应液,得到平末端DNA序列,进一步进行加尾反应;3加入连接反应体系,完成反应后加入外切酶处理,其中,所述反应体系包含连接子和连接酶,所述连接子为双链结构且具有突出的胸腺嘧啶;4解交联后纯化DNA进行测序;其中,所述植物叶肉细胞的样本起始量低于0.1g;所述交联缓冲液包含10-40mM的Hepes、100-400mM蔗糖、0.01-5mM的MgCl2,0.01-2mM的KCl、10-45%甘油、0.01-2%的TritonX-100、0.01-2mM苯基甲磺酰氟、0.01-2%的2-巯基乙醇、0.1-10%甲醛和0.01-2M的乙二醇双琥珀酰亚胺琥珀酸酯;步骤1中,所述研磨通过研磨机进行,其参数包括30-90秒、30-90赫兹、2-8个循环。

全文数据:

权利要求:

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