龙图腾网&IPTOP
- 微信扫码登录
- 账号密码登录
- 短信登录/注册
买专利卖专利找龙图腾，真高效！ 查专利查商标用IPTOP,全免费！专利年费监控用IP管家,真方便！
申请/专利权人：电子科技大学长三角研究院(衢州)
摘要：本方案公开了一种基于ATAC‑seq足迹识别转录因子共定位的方法，首先根据ATAC‑seq数据，使用HINT‑ATAC方法进行数据预处理，然后基于泊松分布构建识别转录因子共定位模型，基于距离ds实现协同结合和竞争结合的转录因子对的识别，通过仅使用ATAC‑seq数据作为输入，就能识别协同结合和竞争结合的转录因子对，为进一步应用于多个细胞系提供基础。
主权项：1.一种基于ATAC-seq足迹识别转录因子共定位的方法，其特征在于，该方法包括：S1.收集并下载待识别目标的ATAC-seq数据，以获取原始的染色质开放性测序数据；S2.基于步骤S1获取的数据文件，使用足迹分析工具分析转录因子足迹在待识别目标基因组中的坐标数据；S3.利用转录因子数据库的转录因子motif与足迹坐标数据进行匹配，以获取每个结合位点的具体转录因子种类；所述的转录因子数据库收录有不同生物的转录因子与结合位点及结合方式；S4.通过距离计算工具计算每两种转录因子之间的距离ds；根据计算的ds，以第一距离阈值为准确定两种转录因子的共定位数k1；根据计算的ds，以第二距离阈值为准确定两种转录因子的共定位数k2；S5.基于泊松分布构建识别转录因子共定位模型；使用识别转录因子共定位模型分别计算k1、k2两种情况下的概率值P；根据概率值P和阈值P’分别筛选两种情况下具有显著性的转录因子对；S6.对于第二距离阈值的情况，将k1大于期望值的显著性转录因子对判断为协同结合的转录因子对；对于第一距离阈值情况，将k2大于期望值的显著性转录因子对判断为竞争结合的转录因子对；根据竞争结合的转录因子对判断各协同结合的转录因子对是否同时属于竞争结合，若是，则将相应转录因子对判断为既竞争又协同。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 电子科技大学长三角研究院(衢州) 一种基于ATAC-seq足迹识别转录因子共定位的方法
免责声明
1、本报告根据公开、合法渠道获得相关数据和信息，力求客观、公正，但并不保证数据的最终完整性和准确性。
2、报告中的分析和结论仅反映本公司于发布本报告当日的职业理解，仅供参考使用，不能作为本公司承担任何法律责任的依据或者凭证。
主营中国专利交易买卖与专利转让许可,高校科技成果推广与科技成果转化,知识产权运营管理与平台开发,科技人才专家库与科技猎头等科技服务
开放平台
担保交易
惠及多方
会员特惠
专属平台
适合多方
数据共享
功能齐全
皖公网安备 34010402703815号