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申请/专利权人：上海鲸舟基因科技有限公司
摘要：本发明提供了一种特异性检测5hmC的方法，具体地，本发明的方法包括如下步骤：a提供一待测样本，将样本中的DNA打断，从而得到片段化DNA，所述片段化DNA含有碱基C、5mC和5hmC；b用β‑葡糖基转移酶处理所述片段化DNA，从而获得第一产物，所述第一产物包括带有β‑葡糖基的5hmC；c用胞嘧啶脱氨酶处理所述第一产物，将第一产物中的C与5mC脱氨基，转换为碱基U，从而获得第二产物，所述第二产物中的5hmC不转换为碱基U；d将所述第二产物进行扩增，碱基U转换为T之后对所述扩增产物进行检测；e分析步骤（d）获得的检测数据，从而特异性检测5hmC，非常具有应用前景。
主权项：1.一种特异性检测5hmC的方法，其特征在于，所述方法包括步骤：a提供一待测样本，将样本中的DNA打断，从而得到片段化DNA，所述片段化DNA含有碱基C、5mC（5-甲基胞嘧啶-）和5hmC（5-羟甲基胞嘧啶）；b用β-葡糖基转移酶处理所述片段化DNA，从而获得第一产物，所述第一产物包括带有β-葡糖基的5hmC；c用胞嘧啶脱氨酶处理所述第一产物，将第一产物中的C与5mC脱氨基，转换为碱基U，从而获得第二产物，所述第二产物中的5hmC不转换为碱基U；d将所述第二产物进行扩增，碱基U转换为T之后对所述扩增产物进行检测；e分析步骤（d）获得的检测数据，从而特异性检测5hmC；所述胞嘧啶脱氨酶来自NEB（NEBNext®EnzymaticMethyl-seqKit）试剂盒中的胞嘧啶脱氨酶，在步骤（d）中，用以下技术进行检测：基因芯片。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 上海鲸舟基因科技有限公司 一种特异性检测5hmC的方法
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