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一种芋全基因组SNP-Panel及其应用 

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申请/专利权人:武汉市农业科学院

摘要:本发明属于分子育种技术领域,具体涉及一种芋全基因组SNP‑Panel及其应用。本发明要解决的技术问题是开发一种覆盖芋全基因组的通量高、成本低的分子标记检测体系。本发明的技术方案是一种芋全基因组SNP‑Panel,包括695个SNP位点以及所述SNP位点的扩增引物。利用所述SNP‑Panel通过一次扩增反应,可实现695个SNP位点的同时检测,具有很好的应用前景。

主权项:1.芋全基因组SNP-Panel在建立芋DNA指纹数据库和或遗传多样性分析中的应用,其特征在于:包括695个SNP位点以及所述SNP位点的扩增引物,所述695个SNP位点信息及扩增引物序列如表1所示;所述建立芋DNA指纹数据库的步骤如下:利用上述695个SNP位点的引物对芋的基因组DNA进行混合PCR扩增,扩增产物经测序、分型,获得芋在所述695个SNP位点上的的基因型数据,即构成芋DNA指纹数据库;所述遗传多样性分析的步骤如下:在获得芋DNA指纹数据库后,对待分析样本建立聚类树状图,计算遗传多样性参数,即可得到芋的遗传多样性分析结果;表1695个SNP位点信息及扩增引物序列 表1中的染色体上的碱基位置是以公开的芋基因组序列Taro_JAAS_v1.0作为参照。

全文数据:

权利要求:

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