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申请/专利权人:西安交通大学
摘要:本发明公开了一种基于不同碱基转换方式的DNA损伤区分测序方法,属于DNA损伤测序领域。利用在不同的DNA损伤位点处聚入不同的修饰碱基组合,在损伤位点处产生不同的碱基转换信号,利用二代测序技术,实现对不同损伤位点的区分标记与检测。该检测方法中产生不同的碱基转换信号以标记不同损伤位点的步骤包括:通过损伤酶将损伤位点处理为3’羟基,用切口平移聚入不同的修饰碱基组合,被聚合酶连续聚入的修饰碱基在测序中可产生连续的碱基转换信号,被聚合酶非连续聚入的修饰碱基在测序中可产生非连续的碱基转换信号;基于此,在核酸扩增中损伤位点处产生不同类型的碱基转换信号,实现对不同损伤位点的区分标记与检测。
主权项:1.一种基于不同碱基转换方式的DNA损伤区分测序方法,其特征在于,步骤如下:1将损伤酶、聚合酶和若干条含有不同种DNA损伤位点的核酸链进行共孵育,以通过聚入修饰碱基组合标记DNA损伤位点;其中,所述损伤酶为与核酸链损伤位点对应的损伤酶;2在上一步产物的基础上,继续加入损伤酶和聚合酶进行共孵育;3重复步骤2若干次,直到所有不同种DNA损伤位点均被不同修饰碱基组合区分标记;4对步骤3得到的产物进行核酸文库构建与核酸扩增,通过测序表征不同修饰碱基组合在不同DNA损伤位点处产生不同的碱基转换信号,实现对不同损伤位点的损伤区分测序。
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百度查询: 西安交通大学 一种基于不同碱基转换方式的DNA损伤区分测序方法
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