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一种应用circRNA作为喉癌预后标志物的方法 

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申请/专利权人:山东一点基因科技有限公司

摘要:本发明公开了一种应用circRNA作为喉癌预后标志物的方法,属于喉癌预后诊断技术领域;包括以下步骤:第一步,样本采集,从喉癌患者中采集组织样本,提取总RNA,并使用高通量RNA测序技术获取circRNA表达谱;第二步,circRNA筛选,筛选出不同iallyexpressedcircRNAs;第三步,建立预测模型,利用机器学习算法,结合患者的临床数据和DEcircRNAs,建立喉癌预后的预测模型;第四步,验证模型的准确性;第五步,基于circRNA预测模型的应用,采用适应性生信分析方法,为医生提供患者的circRNA表达谱和预后评估结果;本发明的应用circRNA作为喉癌预后标志物的方法,通过引入环状RNA(circRNA)作为喉癌预后评估的新指标,实现了更高的准确性、个体化治疗和分子机制解析。

主权项:1.一种应用circRNA作为喉癌预后标志物的方法,其特征在于,包括以下步骤:第一步,样本采集,从喉癌患者中采集组织样本,提取总RNA,并使用高通量RNA测序技术获取circRNA表达谱;第二步,circRNA筛选,应用生物信息学分析方法,对喉癌组织与正常组织的circRNA表达谱进行比较,筛选出不同iallyexpressedcircRNAs,得到DEcircRNAs;第三步,建立预测模型,利用机器学习算法,结合患者的临床数据和DEcircRNAs,建立喉癌预后的预测模型;第四步,验证模型的准确性,利用交叉验证方法,对模型进行内部验证;同时,将模型应用于独立的喉癌患者样本集,评估其预测准确性和稳定性;第五步,基于circRNA预测模型的应用,采用适应性生信分析方法,为医生提供患者的circRNA表达谱和预后评估结果;同时,整合生信数据,进行生物通路分析,深入理解喉癌的分子机制。

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