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一种基于理性设计改造的κ-卡拉胶酶突变体及其制备方法 

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申请/专利权人:集美大学;厦门医学院

摘要:本发明提供了一种基于理性设计改造的κ‑卡拉胶酶突变体及其制备方法,该方法利用AutoDock和PyMOL软件工具进行蛋白质底物结合分析及蛋白结构显示,结合Hole分析预测κ‑卡拉胶酶催化活性提高的突变位点,再结合序列保守性分析筛选鉴定得酶活提高突变体I149F;将野生型κ‑卡拉胶酶在其I149F的突变位点进行突变,产生κ‑卡拉胶酶突变体。该方法可提高酶的催化活性,突变酶的酶活力提高约107%;在45℃处理30min后,与野生型κ‑卡拉胶酶相比,突变酶的残余活力比野生型酶高出15%左右,从而使该酶活提高κ‑卡拉胶酶在卡拉胶寡糖工业生产中具有良好的应用前景。

主权项:1.一种基于理性设计改造的κ-卡拉胶酶突变体的制备方法,其特征在于,包括以下步骤:S1、酶的三维结构建模:将野生型κ-卡拉胶酶Pcar16及该酶突变体N205C-G239C的氨基酸序列输入AlphaFold2,对酶的三维结构进行预测,运行结束后,生成得到相关文件;S2、酶构象合理性评估:对S1步骤获得的模型使用SAVESv6.0评分程序对蛋白质构象合理性进行评估,选择模型进行后续实验;S3、蛋白与底物进行分子对接:利用AutoDock软件工具将步骤S2获得的野生型κ-卡拉胶酶Pcar16及突变体N205C-G239C模型分别进行蛋白质底物结合分析、用PyMOL软件进行蛋白结构显示;S4、底物通道分析:将步骤S3得到的分子对接结果进行Hole分析,野生型κ-卡拉胶酶Pcar16与突变体N205C-G239C的底物通道叠合,寻找通道宽窄差别明显的点位列为待突变的位点。S5、氨基酸保守性分析:将野生型蛋白酶的结构模型或氨基酸序列提交至Consur服务器运行,进行筛选,将步骤S4筛选到的突变位点与该结果结合,选择非高度保守的残基进行突变获得突变文库,筛选出酶活提高最佳的突变位点I149F;S6、将野生型κ-卡拉胶酶Pcar16在其I149F的突变位点进行突变,产生κ-卡拉胶酶突变体。

全文数据:

权利要求:

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