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申请/专利权人：浙江大学
摘要：本发明提供了一种猪品种异质性位点鉴别方法，该方法包括以下步骤：收集猪SNP数据；SNP数据整合、未成功分型的位点填充、过滤，最后生成参考数据集；基于参考数据集、测试多种异质性位点筛选方法，并确定最佳筛选方法；参考集中提取用户选定的待区分品种的SNP信息；计算用户选取的品种间的异质性位点；根据用户所需的异质位点数量提取异质性位点；交叉验证评估异质性位点的性能；生成报告，发送到用户邮箱。本发明提供了一套用于进行品种异质性位点筛选的芯片数据，包含来自世界各地的124个猪品种类群的3605头猪，每个样本均有45743个SNP位点，达到快速高效地鉴别猪品种间异质位点效果。
主权项：1.一种猪品种异质性位点鉴别方法，其特征在于，该方法包括以下步骤：S1：收集猪SNP数据；S2：SNP数据整合、未成功分型的位点填充、过滤，最后生成参考数据集；S3：基于参考数据集、测试多种异质性位点筛选方法，并确定最佳筛选方法；S4：参考集中提取用户选定的待区分品种的SNP信息；S5：计算用户选取的品种间的异质性位点；S6：根据用户所需的异质位点数量提取异质性位点；S7：交叉验证评估异质性位点的性能；S8：生成报告，发送到用户邮箱。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 浙江大学 一种猪品种异质性位点鉴别方法
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