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与棉花果枝始节高度性状关联的SNP位点及其应用 

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申请/专利权人:浙江大学

摘要:本发明公开了一个与棉花果枝始节高度性状关联的SNP位点及其应用。本发明基于一套陆地棉自然群体的全基因组重测序数据及两年田间表型调查,进行全基因组关联分析后鉴定到一个稳定的与棉花果枝始节高度相关联的SNP位点,该位点位于陆地棉A05染色体上15876258bp的碱基处,该位点为T至C的单碱基突变,TT型的棉花果枝始节高度显著高于CC型棉花。在棉花机械化采收过程中,果枝始节高度是棉花品种是否适宜机械化采收的重要参数。本发明提供的与棉花果枝始节高度性状关联的SNP位点可以应用于筛选陆地棉适宜机械化采收的种质资源材料,也可以应用于机采棉棉花材料的分子标记辅助育种,加快棉花适宜机采棉新品种选育进程,为棉花全程机械化奠定基础。

主权项:1.一个与棉花果枝始节高度性状关联的SNP位点,其特征在于,所述SNP位点位于陆地棉遗传标准系TM-1参考基因组A05染色体上15876258bp的碱基处,所述SNP位点上下游200bp的核苷酸序列如SEQIDNO.5所示,该位点位于SEQIDNO.5的200bp处;所述SNP位点为T至C的单碱基突变,T碱基对应的棉花的果枝始节高度高于C碱基对应的棉花。

全文数据:

权利要求:

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