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多组学癌症亚型分类方法、系统、设备、介质及程序产品 

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申请/专利权人:山东大学

摘要:本发明公开一种多组学癌症亚型分类方法、系统、设备、介质及程序产品,涉及机器学习技术领域,包括:提取多组学数据的组学特征集;在给定所有亚型类别标签的条件下,考虑组学特征‑标签相关性、组学特征‑组学特征相关性和标签‑标签相关性,提取每个亚型类别的局部因果特征;在给定单亚型类别标签的条件下,提取组学特征集中与给定亚型类别有因果关系的局部因果特征;将两部分局部因果特征合并后,进行选择性纠正,删除与亚型类别无关的组学特征,得到多组学数据的因果组学特征集;对因果组学特征集进行癌症亚型分类,得到目标个体的癌症亚型类型。考虑特征和类属性间的因果关系,排除导致混淆的特征,提高分类精度。

主权项:1.一种多组学癌症亚型分类方法,其特征在于,包括:获取目标个体的多组学数据,提取多组学数据的组学特征集,所述提取多组学数据的组学特征集的过程包括:对每个组学数据经编码得到组学特征,将多组学特征融合后得到组学特征集; ; ;其中,为第个组学数据的组学特征;为多组学数据的组学特征集;为特征连接函数;为第层编码器的权重;为连接层的权重;为第层编码器的偏置;为连接层的偏置;所述提取组学特征集的过程中以最小化损失函数为目标函数: ; ; ; ;其中,是第个组学数据的重构误差损失函数;是分类误差损失函数;是调节第个重构误差损失函数贡献的权重系数;是调节分类误差损失函数贡献的权重系数;为重建的第个组学数据;为第层解码器的权重;为第层解码器偏置;为激活函数;J为癌症亚型类别数量;为第j个亚型类别;为局部因果特征;在给定所有亚型类别标签的条件下,通过考虑组学特征-标签相关性、组学特征-组学特征相关性和标签-标签相关性,提取每个亚型类别的局部因果特征;在给定单亚型类别标签的条件下,提取组学特征集中与给定亚型类别有因果关系的局部因果特征;将两部分局部因果特征合并后,通过对称性约束规则进行选择性纠正,以删除与亚型类别无关的组学特征,由此得到多组学数据的因果组学特征集;对因果组学特征集进行癌症亚型分类,得到目标个体的癌症亚型类型。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 山东大学 多组学癌症亚型分类方法、系统、设备、介质及程序产品

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