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一组SNP分子标记作为检测靶点在鉴定中国南瓜种质资源中的应用 

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申请/专利权人:浙江省农业科学院

摘要:本发明属于生物技术领域,公开了一组SNP分子标记作为检测靶点在鉴定中国南瓜种质资源中的应用,本发明利用南瓜种质资源基因组重测序信息,基于特定的参数和条件,从数百万个SNP位点中挑选具有代表性、多态性好的位点,筛选出25个核心SNP位点用于开发SNP分子标记,进而获得多态性较高且在各条染色体均匀分布的25个核心SNP分子标记并转化为KASP引物;可为南瓜种质资源的鉴定、南瓜DNA指纹图谱构建、南瓜亲缘关系分析、南瓜品种权保护等奠定重要的技术支撑。

主权项:1.一组SNP分子标记作为检测靶点在鉴定中国南瓜种质资源中的应用,其特征在于,所述SNP分子标记包括如SNP1~25所示的SNP标记:所述SNP1差异碱基GC,位于南瓜1号染色体基因组序列的第8067852位;所述SNP2差异碱基TC,位于南瓜2号染色体基因组序列的第1125559位;所述SNP3差异碱基GA,位于南瓜3号染色体基因组序列的第2407491位;所述SNP4差异碱基CT,位于南瓜3号染色体基因组序列的第7694202位;所述SNP5差异碱基GA,位于南瓜4号染色体基因组序列的第11847205位;所述SNP6差异碱基TG,位于南瓜4号染色体基因组序列的第12078770位;所述SNP7差异碱基TA,位于南瓜4号染色体基因组序列的第17601626位;所述SNP8差异碱基TG,位于南瓜5号染色体基因组序列的第6361531位;所述SNP9差异碱基CT,位于南瓜6号染色体基因组序列的第9963691位;所述SNP10差异碱基CT,位于南瓜7号染色体基因组序列的第7662052位;所述SNP11差异碱基AC,位于南瓜11号染色体基因组序列的第7244778位;所述SNP12差异碱基TG,位于南瓜11号染色体基因组序列的第7323225位;所述SNP13差异碱基CA,位于南瓜12号染色体基因组序列的第5932910位;所述SNP14差异碱基TC,位于南瓜12号染色体基因组序列的第6638035位;所述SNP15差异碱基AG,位于南瓜13号染色体基因组序列的第3199364位;所述SNP16差异碱基GC,位于南瓜14号染色体基因组序列的第7306064位;所述SNP17差异碱基GA,位于南瓜15号染色体基因组序列的第499307位;所述SNP18差异碱基CG,位于南瓜16号染色体基因组序列的第6577835位;所述SNP19差异碱基TG,位于南瓜17号染色体基因组序列的第4382782位;所述SNP20差异碱基CG,位于南瓜17号染色体基因组序列的第4985309位;所述SNP21差异碱基GA,位于南瓜17号染色体基因组序列的第499985位;所述SNP22差异碱基GC,位于南瓜18号染色体基因组序列的第5648033位;所述SNP23差异碱基AG,位于南瓜19号染色体基因组序列的第3516127位;所述SNP24差异碱基AC,位于南瓜19号染色体基因组序列的第3604243位;所述SNP25差异碱基CT,位于南瓜12号染色体基因组序列的第5918093位。

全文数据:

权利要求:

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