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一种基于单张噪声样本的自监督荧光显微镜图像去噪方法 

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申请/专利权人:复旦大学

摘要:本发明属于数字图像处理技术领域,具体为一种基于单张噪声样本的自监督荧光显微镜图像去噪方法。本发明方法包括:通过在单张有噪声的荧光显微镜图像中进行时空维度的像素采样,生成多个成对的带噪荧光显微镜图像数据;利用构造的成对带噪样本训练一个基于U‑Net结构的去噪网络。实验结果表明,本方法克服了之前荧光显微镜图像去噪方法的缺陷,仅利用单幅有噪声的三维荧光显微镜延时成像数据来训练去噪模型,可有效抑制荧光显微镜图像的噪声,提升图片的清晰度,具有较强的实用价值。

主权项:1.一种基于单张噪声样本的自监督荧光显微镜图像去噪方法,其特征在于,充分利用荧光显微镜延时成像的时空冗余特性,通过在单张有噪声的荧光显微镜图像中进行时空维度的像素采样,生成多个成对的带噪荧光显微镜图像数据;利用构造的成对带噪样本训练一个基于U-Net结构的去噪网络;具体步骤如下:1构造成对带噪样本:采用原始带噪的荧光显微镜延时成像结果,通过空间和时间维度的像素采样操作合成成对的噪声样本;具体地,利用单张带噪荧光显微镜延时成像I∈RT×H×W×D的时空冗余特性,生成T对带噪数据其中,H,W,D,T分别代表图像的高度、宽度、深度和时间帧数;具体做法为:首先,将带噪的延时成像结果I沿时间维度划分为T个时间点的荧光显微镜图像I={I1,I2,...,IT};对每个图像Ii,将其沿空间和时间维度划分为个2×2大小的窗口,当D≥2时,采用个2×2×2的三维窗口;在第个窗口内随机采样两个不同的像素,分别作为输入Xi,j和标签数据Yi,j的像素;2构建图像去噪网络:设计基于U-Net网络结构的荧光显微镜图像去噪模型;记该图像去噪模型为f·,将带噪图像X作为输入,输出去噪后的图像Z=fX具体流程为:首先,图像去噪模型采用编解码器结构,编码器部分由8个卷积层Conv·和三个池化层Pool·组成,表示为:f1=ConvConvX,f2=PoolConvConvf1,f3=PoolConvConvf2,f4=PoolConvConvf3,其解码器由三个上采样层Upscale·和7个卷积层组成,表示为::f′1=ConvConvUpscalef4,f3,f′2=ConvConvUpscalef′1,f2,f′3=ConvConvUpscalef′2,f1,Z=Convf′3;3模型训练:利用步骤1构造的成对噪声样本训练图像去噪模型,训练过程中采用L2损失函数约束模型。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 复旦大学 一种基于单张噪声样本的自监督荧光显微镜图像去噪方法

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