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基因组选择方法、装置、设备、介质及计算机程序产品 

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申请/专利权人:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所

摘要:本发明涉及生物信息学领域,本发明提供一种基因组选择方法、装置、设备、介质及计算机程序产品,包括:对目标畜禽的盲肠内容物样本进行微生物基因测序,得到与RFI相关的ASVs;对目标畜禽进行全基因组范围的SNP位点分型,得到分型结果;基于基因矩阵G对应的第一权重、微生物矩阵M对应的第二权重、ASVs以及分型结果构建权重亲缘关系GM矩阵;G是基于分型结果构建的,M是基于目标畜禽的各ASV的相对丰度构建的;基于目标相对权重对应的GM矩阵进行育种值估计,根据估计的育种值对目标畜禽进行育种;目标相对权重是基于第一权重和第二权重确定的。本发明提高了估计畜禽饲料利用率的相关性状育种值的准确性。

主权项:1.一种基因组选择方法,其特征在于,包括:对目标畜禽的盲肠内容物样本进行微生物基因测序,得到与剩余采食量RFI相关的扩增子序列变体ASVs;对所述目标畜禽进行全基因组范围的单核苷酸多态性SNP位点分型,得到分型结果;基于基因矩阵G对应的第一权重、微生物矩阵M对应的第二权重、所述ASVs以及所述分型结果构建权重亲缘关系GM矩阵;所述基因矩阵G是基于所述分型结果构建的,所述微生物矩阵M是基于所述目标畜禽的各ASV的相对丰度构建的;基于目标相对权重对应的GM矩阵进行育种值估计,根据估计的育种值对所述目标畜禽进行育种;所述目标相对权重是基于所述第一权重和所述第二权重确定的。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 基因组选择方法、装置、设备、介质及计算机程序产品

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