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应用于FPGA加速器的PME算法异构计算方法及装置 

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申请/专利权人:西安电子科技大学

摘要:本发明公开了一种应用于FPGA加速器的PME算法异构计算方法及装置,涉及分子动力学模拟技术领域,解决了现有技术中在使用HBM作为存储器导致的在PME计算过程中数据存取延时长,以及多维FFT计算过程中转置和卷积单独处理导致的存储资源占用多、计算时间长的问题,该方法包括:利用B样条插值将电荷插值至快速傅里叶变换网格,得到静电势能矩阵和系数矩阵;对静电势能矩阵和系数矩阵进行计算,得到静电力矩阵;对静电力矩阵进行B样条插值,得到各个原子的受力情况分析结果;实现了将PME算法卸载到FPGA中,以此提升PME算法的计算速度。

主权项:1.一种应用于FPGA加速器的PME算法异构计算方法,其特征在于,包括:利用B样条插值将电荷插值至快速傅里叶变换网格,得到静电势能矩阵和系数矩阵;对所述静电势能矩阵和所述系数矩阵进行计算,得到静电力矩阵;对所述静电力矩阵进行B样条插值,得到各个原子的受力情况分析结果。

全文数据:

权利要求:

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