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一种基于SNP分子标记的长柱红山茶遗传多样性分析方法 

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申请/专利权人:贵州省生物研究所

摘要:本发明公开了一种基于SNP分子标记的长柱红山茶遗传多样性分析方法,属于生物育种技术领域。本发明采集待测长柱红山茶嫩叶材料提取DNA,对所提取的DNA进行质控后构建DNA文库;DNA文库检测合格后进行DNBSEQ测序,对数据进行质控与过滤最终获得高质量可靠数据后与参考基因组进行比对、排序、标记重复后,进行两次变异检测,最终获得原始经过质量控制的变异数据;将原始经过质量控制的变异数据中的SNP和InDel标记分开后,对SNP数据进行过滤,最终获得高质量SNP数据用于长柱红山茶遗传多样性分析、亲缘关系分析、遗传分化程度分析。为更好地理解长柱红山茶的遗传多样性及其生态和进化意义提供理论基础和实践指南。

主权项:1.一种基于SNP分子标记的长柱红山茶遗传多样性分析方法,其特征在于,包括:1采集待测长柱红山茶嫩叶材料提取DNA,对所提取的DNA进行质控;2DNA样本质控检测合格后构建DNA文库;3DNA文库检测合格后进行DNBSEQ测序,对数据进行质控与过滤最终获得高质量可靠数据;4将所有样本的高质量可靠数据与参考基因组进行比对、排序、标记重复后,进行两次变异检测,最终获得原始经过质量控制的变异数据;5将原始经过质量控制的变异数据中的SNP和InDel标记分开后,对SNP数据进行过滤,最终获得高质量SNP数据用于长柱红山茶遗传多样性分析。

全文数据:

权利要求:

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