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一种牛L0C107132172与OLIG1基因间区16bp indel多态性的快速检测方法 

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申请/专利权人:河南省农业科学院畜牧研究所

摘要:本发明公开了一种牛L0C107132172与OLIG1基因间区的16bpindel多态性的快速检测方法及其应用,属于分子遗传学领域。其中检测方法包括:根据在以上两基因基因间区存在的16bpindel及前人报道的212bp的替换这一特征,设计该位点的上下游引物用P表示。对将要判型的夏南牛群体进行颈静脉采血,提取基因组DNA,用引物对P进行PCR扩增,最后通过琼脂糖凝胶电泳检测该16bpindel多态性,当基因间区存在16bp插入且无212bp替换时,判定为有角夏南牛AABB基因型;当16bp缺失且存在212bp替换时,判定为纯合无角夏南牛aabb基因型;若为杂合无角夏南牛时,基因型为AaBb、Aabb、aaBb。同时,本发明还对夏南牛群体中基因型分布及基因型频率进行了分析,用于夏南牛无角品系的辅助选择和分子育种。本发明建立的分子生物学方法分辨率高、检测灵敏、判型准确、操作简单、成本低、周期短,大大提高了该位点基因型判定的准确性,不需要特殊的仪器,易推广普及。

主权项:1.一种用于检测夏南牛无角系的快速检测方法,其特征在于,主要包括以步骤:1根据牛L0C107132172与OLIG1基因间区的基因序列,设计一对引物P:上游引物P-F:5’-ACGTCTGCGCCTTTCTTGT-3’;下游引物P-R:5’-TCAACATCAAGGACACCTCCC-3’。2以包含牛的序列为模板,利用步骤1设计的引物,进行PCR扩增;3通过琼脂糖凝胶电泳检测该位点的核苷酸多态性,当基因间区存在16bp插入且无212bp替换时,扩增产物为一条带,条带大小为246bp,判定为有角夏南牛AABB基因型;当16bp缺失且存在212bp替换时,扩增产物为两条带,条带大小分别为230bp和448bp,判定为纯合无角夏南牛aabb基因型;若为杂合无角夏南牛时,扩增产物为三条带,条带大小分别为230bp、246bp以及448bp,基因型命名为AaBb、Aabb、aaBb。。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 河南省农业科学院畜牧研究所 一种牛L0C107132172与OLIG1基因间区16bp indel多态性的快速检测方法

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