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申请/专利权人：复旦大学附属华山医院;粤港澳大湾区精准医学研究院(广州)
摘要：本发明提供了一种免疫相关疾病分子分型和亚型分类器的分类方法、系统，包括：在训练集中利用聚类算法进行分子分型，得到多个在训练集中稳定出现的亚型及每个亚型的标记基因；对亚型的标记基因进行富集分析，对亚型进行免疫细胞浸润评估，根据分析和评估结果，得到多种免疫特征稳定的亚型类别；通过比较集比较不同亚型类别的治疗反应率，确定所需识别的亚型类别；利用筛选得到特征基因以及最佳参数组合构建支持向量机模型；鉴别待分类免疫相关疾病数据是否为所需的亚型类别。本发明能够鉴别出具有稳定特征的免疫相关疾病亚型，以利于精准药物选择、以及经济化治疗。本发明适用于各免疫相关疾病的分子分型和亚型分类，并不局限于本文中的实施例。
主权项：1.一种免疫相关疾病分子分型和亚型分类器的分类方法，其特征在于，包括：数据获取步骤：获取免疫相关疾病芯片数据集，将所述免疫相关疾病芯片数据集分为训练集、验证集和比较集；分子分型步骤：在所述训练集中利用聚类算法进行分子分型，得到多个在所述训练集中稳定出现的亚型及每个亚型的标记基因，通过所述验证集验证分子分型结果的稳定性；分析评估步骤：对所述亚型的标记基因进行富集分析，对所述亚型进行免疫细胞浸润评估，根据富集分析和免疫细胞浸润评估的结果，得到多种免疫特征稳定的亚型类别；比较步骤：通过所述比较集比较不同亚型类别的治疗反应率，确定所需识别的亚型类别；分类器构建步骤：利用从所述标记基因中筛选得到的特征基因，以及支持向量机的最佳参数组合，构建支持向量机模型；分类步骤：将待分类免疫相关疾病数据输入所述支持向量机模型，鉴别所述待分类免疫相关疾病数据是否为所需识别的亚型类别。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 复旦大学附属华山医院 粤港澳大湾区精准医学研究院(广州) 免疫相关疾病分子分型和亚型分类器的分类方法、系统
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