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申请/专利权人：中国石油大学(华东)
摘要：本发明提供了一种基于连接网络特征共享的单细胞RNA测序数据识别罕见细胞的方法，涉及生物信息学和单细胞RNA测序领域。方法分为三个步骤：构建细胞连接网络、特征共享分析和网络特征共享识别罕见细胞。首先，基于单细胞RNA测序数据构建反映细胞间相似性的网络。其次，分析每个细胞及其邻居的表达特征，计算罕见性评分。最后，利用罕见性评分在网络中识别罕见细胞。实验表明，该方法在识别罕见细胞方面表现优越，增强了检测的灵敏度和准确性。
主权项：1.一种基于连接网络特征共享的单细胞RNA测序数据中识别罕见细胞的方法，该方法分为以下几个主要步骤，针对罕见细胞数量有限的情况，执行以下步骤：A、构建细胞连接网络：通过分析单细胞的基因表达特征，我们构建了一个细胞连接网络。这个网络反映了细胞之间的相似性关系，有助于识别潜在的罕见细胞。B、特征共享分析：利用细胞连接网络，我们分析每个细胞及其邻居的表达特征，识别出罕见细胞特有的共同表达模式。通过计算罕见性评分，确定细胞的罕见性。C、网络特征共享：基于罕见性评分，在细胞连接网络中识别罕见细胞。该方法通过综合考虑细胞间的相似性和罕见性特征，实现对罕见细胞的精确定位。D、多数据集验证：为了验证方法的有效性，通过多个单细胞RNA测序数据集进行模型评估，确保方法的鲁棒性和可靠性。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 中国石油大学(华东) 单细胞RNA测序数据中的连接网络特征共享可以识别罕见细胞
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