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一种基于级联消化与特征肽段的羊源性乳清蛋白精准定量方法 

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申请/专利权人:陕西科技大学

摘要:本发明提供了一种基于级联消化与特征肽段的羊源性乳清蛋白精准定量方法,从羊奶粉中提取羊源性乳清蛋白后依次使用胰蛋白酶、赖氨酰基内切酶和谷氨酰基内切酶进行级联消化,之后采集原始Raw文件;将标准肽段列表Q1与原始Raw文件中的肽段列表Q2进行匹配,得到相应的蛋白质列表,按序列覆盖率降序排序,前若干个蛋白质进行理论酶切,从得到的所有可能肽段列表中去除肽段列表Q2,获得未识别的肽段列表Q3;以肽段列表Q2对应的肽段序列为输入对卷积神经网络进行训练,之后分析肽段列表Q3,将MSMS谱图集成到搜索引擎MAXQUANT中后对原始Raw文件进行分析,再去除非特异性肽段,通过稳定性、特异性、质谱特性确定用于定量羊源性乳清蛋白的特征肽段,最后利用其含量与酶解效率得到羊源性乳清蛋白的含量及比率。

主权项:1.一种基于级联消化与特征肽段的羊源性乳清蛋白精准定量方法,其特征在于,包括如下步骤:S1,从待测羊奶粉中提取羊源性乳清蛋白后依次使用胰蛋白酶、赖氨酰基内切酶和谷氨酰基内切酶进行级联消化,之后采集原始Raw文件;S2,将所述羊源性乳清蛋白对应的肽段列表Q1与原始Raw文件中的肽段列表Q2进行匹配,得到与肽段列表Q2相应的蛋白质列表,按序列覆盖率对蛋白质列表中的蛋白质进行降序排序,将前若干个蛋白质进行理论酶切,从得到的所有可能肽段列表中去除肽段列表Q2,获得未识别的肽段列表Q3;S3,以肽段列表Q2对应的肽段序列为输入对卷积神经网络进行训练,之后利用训练后的卷积神经网络对肽段列表Q3进行分析,形成预测的MSMS谱图,将所述的MSMS谱图集成到搜索引擎MAXQUANT中后对原始Raw文件进行分析,得到待测样中所有可鉴定的肽段,再去除非特异性肽段,通过稳定性、特异性、质谱特性确定用于定量羊源性乳清蛋白的特征肽段,最后利用所述的特征肽段的含量与酶解效率得到羊源性乳清蛋白的含量及比率。

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百度查询: 陕西科技大学 一种基于级联消化与特征肽段的羊源性乳清蛋白精准定量方法

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