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一种对总的细胞外囊泡和/或其中含有特异性基因的细胞外囊泡进行绝对定量的方法 

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申请/专利权人:上海思路迪生物医学科技有限公司

摘要:本发明涉及一种对总的细胞外囊泡和或其中含有特异性基因的细胞外囊泡进行绝对定量的方法。具体而言,本发明涉及一种对样品中总的细胞外囊泡和或其中含有特异性基因的细胞外囊泡进行定量的方法,其包括以下步骤:a任选地对所述样品进行预处理;b将所述样品用稀释液稀释;c将稀释的样品与反应体系混合;d生成液滴,使得大多数液滴,优选每个液滴包含不多于一个细胞外囊泡;e裂解液滴中的细胞外囊泡;f进行数字液滴PCR(ddPCR)的反应;和g进行ddPCR检测。

主权项:1.一种对样品中总的细胞外囊泡和或其中含有特异性基因的细胞外囊泡进行定量的方法,其包括以下步骤:a任选地对所述样品进行预处理;b将所述样品用稀释液稀释;c将稀释的样品与反应体系混合;d生成液滴,使得每个液滴包含不多于一个细胞外囊泡;e裂解液滴中的细胞外囊泡;f进行数字液滴PCRddPCR的反应;g进行ddPCR检测;h对ddPCR的结果进行分析;i对结果进行判断,其中判断标准包括:针对由N对引物和探针组成的反应体系,对基因1的探针呈阳性的液滴数记为a1,对基因2的探针呈阳性的液滴数记为a2,对基因i的探针呈阳性的液滴数记为ai2≤i≤N,总液滴数记为b,若对基因1到基因i的探针都呈阳性的多阳性液滴数c满足:则判断样品中含有对基因1到基因i都呈阳性的细胞外囊泡;所述基因1到基因i分别为所述细胞外囊泡中普遍包含的管家基因和特异性基因中的一种,并且分别位于不同的核酸序列上;和j定量,其包括:若参与液滴生成的样品总体积为dμL,那么样品中对基因1到基因i都呈阳性的细胞外囊泡数量e计算为当对基因1到基因i都呈阳性的多阳性液滴数c远小于总液滴数b时,对基因1到基因i都呈阳性的细胞外囊泡数量e的计算公式则简化为在样品中该细胞外囊泡的浓度为个μL。

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