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一种基于MLPA技术对菟丝子、油菜籽、莱菔子进行鉴定的方法 

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摘要:本发明公开了一种基于多重连接探针扩增技术对菟丝子、油菜籽、莱菔子进行鉴定的方法,它包括以下步骤:1提取样品基因组DNA;2以基因组DNA为模板,设计特异性引物扩增ITS2序列;3将扩增产物变性后与MLPA探针进行杂交;4将杂交产物进行连接;5利用通用引物对连接产物进行实时荧光定量PCR扩增;6收集熔解曲线信号,观测Tm值。本发明能够在较短的时间内鉴别菟丝子、油菜籽、莱菔子,可有效检测出掺混样品,该方法具有特异性强,灵敏度高等优点,在中药材真伪鉴定领域有很好的应用前景。

主权项:1.一种基于多重连接探针扩增技术对菟丝子、油菜籽、莱菔子进行鉴定的方法,其特征在于包括以下步骤:1)提取样品基因组DNA;2)以步骤1)的基因组DNA为模板,设计特异性引物扩增菟丝子、油菜籽、莱菔子的ITS2序列;3)将扩增产物变性后与MLPA探针进行杂交;4)利用DNA连接酶将步骤3)的杂交产物进行连接;5)利用通用引物对步骤4)的连接产物进行实时荧光定量PCR扩增;6)收集熔解曲线信号,观测Tm值,其中,所述MLPA探针共3组,每一组分别由左探针和右探针组成,各探针的序列如下:第一组菟丝子左探针:GGGTTCCCTAAGGGTTGGACGTCGCCGTGGTTGGCCGAAAGTATTGTCCGTGATTTT;右探针:GTTGATGTCTTGGCGTGCGGTGGATGGGGCGGGTCTAGATTGGATCTTGCTGGCAC;第二组莱菔子左探针:GGGTTCCCTAAGGGTTGGAGGGCGTCTTGACATGCGGTGGTGAATTCAATC;右探针:TCCTCGTCATATCGTCGCTCGTTCCGGTCCCCTCTAGATTGGATCTTGCTGGCAC;第三组油菜籽左探针:GGGTTCCCTAAGGGTTGGAGAGCGTCTTGACATGCGGTGGTGAATTTAATT;右探针:CTCGTCATATAGTCAGTCGTTCCGGTTCTAGATTGGATCTTGCTGGCAC;用于扩增所述菟丝子、油菜籽、莱菔子ITS2序列的特异性引物如下;上游引物:CTCTCGCATCGATGAAGAACG;下游引物:TTGATATGCTTAAACTCAGCGGG;所述通用引物如下:上游引物:GGGTTCCCTAAGGGTTGGA;下游引物:TCTAGATTGGATCTTGCTGGCAC。

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