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申请/专利权人：武汉科技大学
摘要：本发明提供一种用于HIV流行毒株抗体药物筛选的方法，根据该方法可有效筛选出对HIV国内流行毒株具有高亲和力的广谱中和抗体，所述方法具有操作简便、快捷、可视化、高通量等多方面优点，可极大的推进HIV药物的研发和治疗，并且为HIV疫苗设计和HIV‑1的抗体治疗和CAR‑T免疫细胞治疗提供参考。
主权项：1.一种用于HIV流行毒株抗体药物筛选的方法，其特征在于，所述方法包括如下步骤：1）在从HIVsequencedatabase中获取HIV流行毒株的囊膜蛋白序列，利用蛋白质结构数据库ProteinDataBank（PDB）中公开的HIVgp120x-ray晶体衍射结构数据，通过Swiss-Model对其进行同源建模，获得HIV流行毒株的gp120三维结构；操作流程：2）在蛋白质结构数据库ProteinDataBank（PDB）中获取已知的抗gp120蛋白的中和抗体的Fab-gp120复合三维结构；3）利用Pymol将步骤2）中获得Fab-gp120的复合结构中分离出Fab，再利用在线工具处理bnAb的Fab片段，获得bnAb的可变区片段（Fv），所述在线工具包括PDB-Tools、ANARCIWeb、ProABC-2Web;4）利用HAADOCK2.4软件进行分子对接模拟，得到bnAb可变区片段与gp120的对接模型，以及HAADOCK服务器计算的对接分数，选择对接分数低的bnAb即为筛选获得的抗体药物。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 武汉科技大学 一种HIV全人源广谱中和抗体筛选方法及其应用
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