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申请/专利权人：上海信诺佰世医学检验有限公司
摘要：本发明公开了基于宏基因组高通量测序的病原检测系统及方法；所述检测方法包括如下至少之一：公共数据库的清洗，kmer分类信息的S_confidence和L_score的计算过滤，以及基础背景模型和DIC背景模型的污染识别；所述方法能够控制假阳性物种的检出，为下游报告解读和辅助临床医生判断真实病原提供便利。
主权项：1.基于宏基因组高通量测序的病原检测系统，其特征在于，包括：数据库模块，用于构建病原物种数据库；检测模块，用于将宏基因组测序结果与数据库比对获得病原物种鉴定结果；过滤模块，用于对病原物种鉴定结果进行过滤；过滤方法为：基于病原物种数据库构建物种kmer数据库，基于宏基因组序列kmer在物种kmer数据库中对应物种分类树上分布情况判断物种可靠性，用于对已鉴定的病原物种进行过滤；所述可靠性判断过程为：分别计算物种序列的kmer分类到当前物种的数量占总kmer数量的占比S_confidence，以及物种序列的kmer在当前物种节点及其直系节点上的数量占总kmer数量的占比L_score，取S_confidence、L_score均接近1的序列作为可靠序列，取存在2条以上可靠序列的物种作为过滤后的病原物种。
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权利要求：
百度查询： 上海信诺佰世医学检验有限公司 基于宏基因组高通量测序的病原检测系统及方法
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