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申请/专利权人：复旦大学
摘要：本公开涉及噬菌体的结构变异SV的检测方法，其包括样品准备步骤、参考品准备步骤、比对步骤、结构变异检测步骤、结构变异整合步骤和结构变异过滤步骤。本公开还涉及用于检测噬菌体的结构变异的系统，其包括样品准备模块、参考品准备模块、比对模块、结构变异检测模块、结构变异整合模块和结构变异过滤模块。利用本公开的方法和系统在人类肠道噬菌体组中准确识别到了大量的SV，并证实了它们在肠道噬菌体中的普遍存在。
主权项：1.一种用于检测噬菌体的结构变异的方法，其包括以下步骤：1提供包含双链DNA噬菌体的噬菌体基因组样本；2建立噬菌体参考基因组集合并对所述噬菌体参考基因组集合进行预先筛选，得到预先筛选的噬菌体参考基因组集合，所述预先筛选的噬菌体参考基因组集合与噬菌体基因组样本具有至少0.90序列相似度；3将噬菌体基因组中的长序列比对到所述预先筛选的噬菌体参考基因组集合上；4利用至少两个结构变异检测工具检测结构变异，由每个结构变异检测工具生成一个结构变异集合；5将由至少两个结构变异检测工具生成的至少两个结构变异集合进行整合，得到合并的结构变异集合；和6对所述合并的结构变异集合进行过滤，仅保留被至少两个结构变异检测工具共同检测到的结构变异，得到最终的结构变异集合。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 复旦大学 噬菌体结构变异的检测方法
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