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一种基于线粒体基因组的古代动物物种鉴定方法 

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申请/专利权人:吉林大学

摘要:本发明适用于动物分子生物学技术领域,提供了一种基于线粒体基因组的古代动物物种鉴定方法,具体步骤为:首先构建参考序列数据集,然后建立索引,对于需要鉴定物种的古代动物骨骼,在获得原始测序数据后,利用pipeline进行两种比对策略将测序数据与参考数据集进行比对,最后生成两种策略的比对结果文件,统计并筛选最终比对物种的结果。本发明提供的基于线粒体基因组的古代动物物种鉴定方法能够全面地覆盖比对物种的线粒体全基因组序列,运用两种比对策略,最终判定动物遗存所属种属,在验证形态学鉴定结果的同时也弥补形态鉴定无法分辨种属的情况。

主权项:1.一种基于线粒体基因组的古代动物物种鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:步骤1、前期准备:收集动物线粒体全基因组参考序列以构建参考序列数据集,或搜集全部动物后根据纲目科属种进行分组;步骤2、建立索引;步骤3、搭建古DNA分析pipeline用于对原始测序数据进行比对分析;比对步骤配置两种比对策略,两种比对策略为分别比对和合并比对;步骤4、结果统计;步骤5、最终比对:使用鉴定物种的线粒体全基因组作为参考序列进行比对,获得最终物种的线粒体一致性序列。

全文数据:

权利要求:

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