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申请/专利权人：中山大学

摘要：本发明公开了一种铂类交联肽段的鉴定方法，通过对铂类交联剂和蛋白质进行交联并酶切得到的各候选铂类交联肽段进行质谱鉴定，得到各候选铂类交联肽段的谱图数据，并基于各候选铂类交联肽段的谱图数据获取质谱不可断裂的碎片离子、质谱可断裂的碎片离子、α肽段和β肽段均发生断裂的碎片离子以及铂类交联剂侧链断裂生成的碎片离子，进而筛选得到铂类交联肽段，实现了铂类交联肽段的精准鉴定；并基于碎片离子对铂类交联肽段的交联位点实现精准定位。利用该鉴定方法既能够鉴定得到更多数量的铂类交联肽段，同时能保证鉴定的准确性，还能准确定位铂类交联肽段的交联位点，实现蛋白质结构解析以及指导铂类药物的耐药性和或毒性研究。

主权项：1.一种铂类交联肽段的鉴定方法，其特征在于，包括以下步骤：S1.将铂类交联剂和蛋白质进行交联并酶切，得到各候选铂类交联肽段并进行质谱检测，得到各候选铂类交联肽段的谱图数据；S2.将步骤S1得到的各候选铂类交联肽段的谱图数据输入至pLink2软件中进行鉴定，得到各候选铂类交联肽段的α肽段和β肽段，并匹配出各候选铂类交联肽段的碎片离子y离子和b离子，以及质谱不可断裂的铂类交联肽段碎片离子Y离子和B离子；S3.将步骤S2得到的各候选铂类交联肽段的α肽段和β肽段分别输入MS2-autoassign-Pt中，通过同位素匹配去除假阳性数据后得到各筛选后铂类交联肽段，并鉴定出各筛选后铂类交联肽段的α肽段和β肽段的质谱可断裂的碎片离子Y’离子和B’离子，以及步骤S1所示铂类交联剂侧链断裂的碎片离子1；所述假阳性数据为：同位素匹配结果中少于2个带有3根含铂同位素峰的碎片离子的候选铂类交联肽段；S4.将步骤S3得到的各筛选后铂类交联肽段的α肽段和β肽段同时输入MS2-autoassign-Pt中进行鉴定，得到各筛选后交联肽段的α肽段和β肽段均发生断裂的碎片离子Y”离子和B”离子，以及步骤S1所示铂类交联剂侧链断裂的碎片离子2；S5.合并步骤S2得到的y离子、b离子、Y离子、B离子、步骤S3得到的Y’离子、B’离子、碎片离子1、步骤S4得到的Y”离子、B”离子和碎片离子2，得到各筛选后铂类交联肽段的碎片离子库；S6.去除步骤S3得到的各筛选后铂类交联肽段中不符合条件的肽段，得到铂类交联肽段；所述条件为：筛选后铂类交联肽段中至少含有4个步骤S5得到的碎片离子库中的碎片离子。

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