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结核分枝杆菌菌株类型的鉴定方法 

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摘要:本申请涉及微生物鉴定领域,特别是涉及一种结核分枝杆菌的菌株类型的鉴别方法。特别涉及检测目标区域的结核分枝杆菌的特异性位点在结核菌株类型鉴别中的应用。本申请利用结核分枝杆菌的特异性位点进行结核菌株类型鉴定不但能够准确判断结核分枝杆菌的菌株类型,而且极大节约了菌株类型鉴定需要的时间成本和计算资源,对于结核分枝杆菌的快速诊断和及时治疗具有重要的临床意义。

主权项:1.检测特异性位点的试剂在制备结核分枝杆菌的鉴别产品中的应用;以结核分枝杆菌标准株H37Rv的基因组为参考基因组,所述特异性位点包括检测如下一种或者多种的结核分枝杆菌的特异性位点:鉴别胃分枝杆菌的特异性位点528892_C_G、529051_G_C或者529078_T_C;鉴别哥伦比亚分枝杆菌的特异性位点529012_G_A或者529024_C_G;鉴别海分枝杆菌的特异性位点528995_C_T和529009_C;鉴别溃疡分枝杆菌的特异性位点528811_C_T或者529003_G_A;鉴别脓肿分枝杆菌脓肿亚种的特异性位点528886_G_T、528889_G_T和528898_G_C;鉴别脓肿分枝杆菌博莱亚种的特异性位点528958_C_T、528961_C_T和529000_C;鉴别伤口分枝杆菌的特异性位点529048_A、529054_T或者529078_T;鉴别加纳利群岛分枝杆菌的特异性位点528919_C_T或者529096_G_A;鉴别托斯卡纳分枝杆菌528952_C、529078_T_C或者529084_G_C;鉴别偶发分枝杆菌的特异性位点528892_C_A或者528907_C_T;鉴别牛分枝杆菌的特异性位点2289071_C_G和2156465_C_T;鉴别山羊分枝杆菌的特异性位点5752_G_A或者6307_T_G;鉴别田鼠分枝杆菌的特异性位点5671_C_T或者1473079_G_A;鉴别海豹分枝杆菌的特异性位点1674520_C_T或者1473094_T_C;鉴别非洲分枝杆菌的特异性位点4327103_T_A、1673338_G_A、1674434_T_C和1461251_G_T;鉴别猫鼬分枝杆菌的特异性位点1476719_C_A;鉴别米氏分枝杆菌的特异性位点1476664_T_G;鉴别卡氏分枝杆菌的特异性位点648856_T_C或者649601_C_T;鉴别牛分枝杆菌的特异性位点2289071_C_G和2156465_C;鉴别奇美拉分枝杆菌的特异性位点2371385_T_A、2370533_A_G、1870566_C_T或者1870236_A_G;鉴别副胞内分枝杆菌的特异性位点2371385_T_C、2370533_A_C、1870566_C_G或者1870236_A_C;鉴别胞内分枝杆菌复合群的特异性位点528892_C_T或者529084_G_C;鉴别马萨分枝杆菌的特异性位点528907_C_T或者529012_G_A;鉴别蒂莫内分枝杆菌的特异性位点528856_C_T、528889_G、528892_C_T、528919_C_T、528928_G_C、529012_G_A或者529051_G。

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