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摘要:本发明公开了一种基于单细胞测序区分嵌合体动物模型中异种杂交样本遗传物质和细胞物种来源的方法,该方法基于单细胞测序技术,不依赖测序前细胞分离,利用多重基因组比对分离多物种混合样本。其中所述基于多重基因组比分离多物种混合物的计算方法包括:根据样本多次无监督比对至目标物种参考基因组结果中的遗传物质比例进行统计学分布建模;根据遗传物质比例的统计学分布建模进行样本来源概率预测。本发明所建立的基于多重基因组比的多物种样本分离方法能够对异种杂交生物学样本中不同物种的遗传物质的来源进行较为精准的判定。
主权项:1.一种基于多重基因组比的多物种样本分离方法,其特征在于,建立一套异种杂交生物学样本生物学来源判别方法,所述方法的步骤如下:1从未作额外标记的嵌合动物样本中获取组织样本;2获取组织样本混合物种细胞悬液,不做额外标记、分离,沉淀处理,直接进行单细胞测序;3获取嵌合组织单细胞转录组;4对嵌合组织单细胞转录组每个细胞独立进行多重比对;5将每个细胞测序读段分别对比到宿主与嵌合物种标准参考基因组;6将每个细胞的宿主与嵌合物种比对记录纳入统计分布分析,获得全部细胞多重比对结果的统计分布模式;7计算多重比对分离阈值;8根据阈值标记分离宿主和嵌合细胞。
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百度查询: 笙源生命科技(浙江安吉)有限公司 一种基于单细胞测序区分嵌合体动物模型中异种杂交样本遗传物质和细胞物种来源的方法
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