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一种提高微球矩阵空间转录组捕获面积的方法及其应用 

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摘要:本发明涉及一种提高微球矩阵空间转录组捕获面积的方法及其应用。所述方法包括:进行组织透化处理,使用微球矩阵捕获芯片进行捕获,随后进行反转录和cDNA一链合成、cDNA二链合成,将微球矩阵捕获芯片进行分区,对每个区域解链以及cDNA扩增,对扩增产物进行纯化。本发明设计提高微球矩阵空间转录组捕获面积的方法,将芯片进行破碎分区或者使用杂交垫片设置分区进行检测,操作简单易行,并不需要直接提高条形码的种类,减少了扩大微球池时,合成微球引物的数量以及解码探针的种类,有效节省成本,另外也无需更多的解码轮次即可实现微球芯片的解码,能减少解码过程对捕获芯片的损伤,有效提高了大尺寸空间转录组芯片捕获的效率。

主权项:1.一种提高微球矩阵空间转录组捕获面积的方法,其特征在于,所述方法包括:进行组织透化处理,使用微球矩阵捕获芯片进行捕获,随后进行反转录和cDNA一链合成、cDNA二链合成,将微球矩阵捕获芯片进行分区,对每个区域解链以及cDNA扩增,对扩增产物进行纯化;所述分区的方法包括芯片破碎分区法或杂交垫片分区法;所述芯片破碎分区法包括将微球矩阵捕获芯片破碎为多个分区;所述杂交垫片分区法包括使用杂交垫片对微球矩阵捕获芯片进行分区。

权利要求:

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